Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa - Mikrobiologia (S2)
Sylabus przedmiotu Techniki w diagnostyce mikrobiologicznej z elementami walidacji metod:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Mikrobiologia | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister inżynier | ||
| Obszary studiów | charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Techniki w diagnostyce mikrobiologicznej z elementami walidacji metod | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Mikrobiologii Stosowanej i Fizjologii Żywienia Człowieka | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Elżbieta Bogusławska-Wąs <Elzbieta.Boguslawska-Was@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Alicja Dłubała <Alicja.Dlubala@zut.edu.pl>, Barbara Szymczak <Barbara.Szymczak@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 4,0 | ECTS (formy) | 4,0 |
| Forma zaliczenia | egzamin | Język | polski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Mikrobiologia ogólna |
| W-2 | Mikrobiologia szczegółowa |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Zapoznanie się i praktyczne poznanie zasad diagnostyki mikrobiologicznej |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| T-A-1 | Zasady pobierania materiałów w diagnostyce mikrobiologicznej. | 1 |
| T-A-2 | Teoretyczne podstawy walidacji i weryfikacji metod i testów mikrobiologicznych | 2 |
| T-A-3 | Teoretyczne podstawy metod wykorzystywanych w serotypowaniu bakterii | 2 |
| T-A-4 | MALDI TOF MS jako zaawansowana metoda identyfikacji bakterii. | 2 |
| T-A-5 | Oznaczanie kwasów tłuszczowych jako metoda identyfikacji bakterii. Różnice w składzie kwasów tłuszczowych u bakterii Gram+ i Gram- | 2 |
| T-A-6 | Zastosowanie spektrofotometrii INFRARED w diagnostyce mikrobiologicznej. | 2 |
| T-A-7 | Metody genotypowe w identyfikacji drobnoustrojów. | 2 |
| T-A-8 | Zaliczenie na podstawie prezentacji | 2 |
| 15 | ||
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Wyznaczenie podstawowych parametrów uwzględnianych w walidacji i weryfikacji metod i testów diagnostycznych | 6 |
| T-L-2 | Szacowanie niepewności pomiaru metod mikrobiologicznych ilościowych i jakościowych. | 4 |
| T-L-3 | Wykorzystanie genetycznych metod w serotypowaniu bakterii | 6 |
| T-L-4 | Wykorzystanie metody ELISA w różnicowaniu serologicznym drobnoustrojów. | 3 |
| T-L-5 | Wykorzystanie testów API w identyfikacji i różnicowaniu mikroorganizmów | 3 |
| T-L-6 | Ilościowa identyfikacja mikroorganizmów metoda Real-Time PCR. | 6 |
| T-L-7 | Wykorzystanie metody PCR-DGGE do badania zmienności genotypowej bakterii. | 4 |
| T-L-8 | Techniki elektroforetyczne. | 6 |
| T-L-9 | Elektroforeza białek. | 5 |
| T-L-10 | Zaliczenie zajęć | 2 |
| 45 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Podstawowe pojęcia zwiążane z waliidacją. | 2 |
| T-W-2 | Parametry walidacji, podstawowe wzory i ich zastosowanie. | 3 |
| T-W-3 | Procedury sporządzania dokumentacji w procesach walidacji. | 2 |
| T-W-4 | Najczęstsze problemy przy przeproowadzaniu walidacji. | 2 |
| T-W-5 | Metody jakościowe - wyznaczanie niepewności na poziomie granicy wykrywalności (niepewność inoculum); obliczanie procentu fałszywych wyników (metody jakościowe). | 2 |
| T-W-6 | Zapewnienie jakości wyników badań metod mikrobiologicznych jakościowych oraz ilościowych. Wewnętrzna kontrola jakości badań - analiza próbek rzeczywistych i kontaminowanych. | 2 |
| T-W-7 | Kryteria oceny do badań ilościowych i jakościowych; tworzenie kart kontrolnych. | 2 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| A-A-1 | uczestnictwo w zajęciach | 15 |
| A-A-2 | Czytanie wskazanej literatury | 4 |
| A-A-3 | Przygotowanie do kolokwium | 4 |
| A-A-4 | Przygotowanie prezentacji. | 2 |
| 25 | ||
| laboratoria | ||
| A-L-1 | uczestnictwo w zajęciach | 45 |
| A-L-2 | Przygotowanie merytoryczne do zajęć. | 5 |
| 50 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Uczestnictwo w zajęciach. | 15 |
| A-W-2 | Samodzielne studiowanie literatury. | 6 |
| A-W-3 | Przygotowanie do egzaminu. | 2 |
| A-W-4 | udział w egzaminie pisemnym | 2 |
| 25 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | Wykład konwersatoryjny |
| M-2 | Ćwiczenia laboratoryjne |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: Ocena formująca |
| S-2 | Ocena formująca: Ocena podsumowująca |
Zamierzone efekty uczenia się - wiedza
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_B6_W01 Student zna i rozumie w stopniu pogłębionym techniki wykorzystywane w diagnostyce mikrobiologicznej. | MS_2A_W05, MS_2A_W08 | — | — | C-1 | T-A-2, T-A-4, T-A-1, T-A-5, T-A-3, T-A-6, T-A-7 | M-1, M-2 | S-1, S-2 |
Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_B6_U01 Student potrafi prawidłowo dobierać metodę w diagnostyce mikrobiologicznej do identyfikacji różnych grup mikroorganizmów. | MS_2A_U02, MS_2A_U03 | — | — | C-1 | T-A-2, T-A-4, T-A-1, T-A-5, T-A-3, T-A-6, T-A-7, T-L-1, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-2, T-L-7, T-L-8, T-L-6, T-L-9 | M-1, M-2 | S-2 |
Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_B6_K01 Student jest gotowy do pracy w laboratorium mikrobiologicznym i wykonywania analiz diagnostycznych. | MS_2A_K01 | — | — | C-1 | T-A-2, T-A-4, T-A-1, T-A-5, T-A-3, T-A-6, T-A-7, T-L-1, T-L-3, T-L-4, T-L-5, T-L-2, T-L-7, T-L-8, T-L-6, T-L-9 | M-1, M-2 | S-2 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_B6_W01 Student zna i rozumie w stopniu pogłębionym techniki wykorzystywane w diagnostyce mikrobiologicznej. | 2,0 | |
| 3,0 | Student zna i rozumie w stopniu dostatecznym techniki wykorzystywane w diagnostyce mikrobiologicznej. | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_B6_U01 Student potrafi prawidłowo dobierać metodę w diagnostyce mikrobiologicznej do identyfikacji różnych grup mikroorganizmów. | 2,0 | |
| 3,0 | Student potrafi w stopniu dostatecznym prawidłowo dobierać metodę w diagnostyce mikrobiologicznej do identyfikacji różnych grup mikroorganizmów. | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_B6_K01 Student jest gotowy do pracy w laboratorium mikrobiologicznym i wykonywania analiz diagnostycznych. | 2,0 | |
| 3,0 | Student w stopniu dostatecznym jest gotowy do pracy w laboratorium mikrobiologicznym i wykonywania analiz diagnostycznych. | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Eligia M. Szewczyk, Diagnostyka bakteriologiczna, PWN, Warszawa, 2019, III
- Kędzia Włodzimierz, Diagnostyka mikrobiologiczna w medycynie, PZWL, Warszawa, 1990
- Mordarska Przondo Anna, Procedury diagnostyki mikrobiologicznej w wybranych zakażeniach układowych, Continuo, Wrocław, 2004
Literatura dodatkowa
- Diagnostic Microbiology
- Stefaniuk E., Bosacka K., Hryniewicz W., Walidacja i weryfikacja metod i testów diagnostycznych w laboratorium mikrobiologicznym, Postępy Mikrobiologii, 2015, 54,4, 415-424