Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa - Mikrobiologia stosowana (S2)
Sylabus przedmiotu Bioinformatyka:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Mikrobiologia stosowana | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister | ||
| Obszary studiów | nauk przyrodniczych | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Bioinformatyka | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Zakład Inżynierii Procesowej i Maszynoznawstwa | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Jerzy Balejko <Jerzy.Balejko@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | |||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | polski |
| Blok obieralny | 6 | Grupa obieralna | 1 |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Podstawowa wiedza z zakresu technologii informacyjnych |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Zapoznanie się z narzedziami i metodami komputerowymi w celu uzyskania odpowiedzi na pytania biologiczne |
| C-2 | Nabycie umiejętności tworzenia modeli matematycznych pozwalających w precyzyjny sposób przewidzieć zachowania złożonych systemów biologicznych |
| C-3 | Zaznajomienie z bazami danych, sposobem ich funkcjonowania i wyszukiwania informacji |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Internet - podłączenie i konfiguracja sprzętu | 2 |
| T-L-2 | Wprowadzenie do baz danych | 2 |
| T-L-3 | Pozyskiwanie informacji i łączność ze zdalną baza danych | 2 |
| T-L-4 | Wprowadzanie sekwencji DNA do baz danych | 4 |
| T-L-5 | Pobieranie informacji z biologicznych baz danych | 3 |
| T-L-6 | Dopasowywanie sekwencji i przeszukiwanie baz danych | 2 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Podstawy Internetu | 2 |
| T-W-2 | Protokoły Internetowe | 2 |
| T-W-3 | Usługi Internetowe | 2 |
| T-W-4 | Bazy danych sekwencji | 1 |
| T-W-5 | Bazy danych struktur molekularnych | 1 |
| T-W-6 | Mapowanie genów | 1 |
| T-W-7 | Bazy danych map | 1 |
| T-W-8 | Pobieranie informacji z biologicznych baz danych | 1 |
| T-W-9 | Dopasowywanie sekwencji | 1 |
| T-W-10 | Analiza porównawcza genomów | 2 |
| T-W-11 | Metody przewidywania wykorzystujące sekwencje białek | 1 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | Uczestnictwo w ćwiczeniach laboratoryjnych | 15 |
| A-L-2 | samodzielna praca z wykorzystaniem komputera | 30 |
| A-L-3 | konsultacje z prowadzacym | 5 |
| A-L-4 | Opanowanie podstaw języka PERL | 10 |
| 60 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | uczestnictwo w wykładach | 15 |
| A-W-2 | Samodzielna praca | 15 |
| 30 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | Wykład informacyjny z prezentacją multimedialną |
| M-2 | Laboratoria komputerowe |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: Ocena aktywności na ćwiczeniach laboratoryjnych |
| S-2 | Ocena podsumowująca: Zaliczenie zadań samodzielnie wykonywanych w trakcie ćwiczeń laboratoryjnych |
| S-3 | Ocena podsumowująca: Kolokwium zaliczające wykłady |
Zamierzone efekty kształcenia - wiedza
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_W01 Posiada wiedzę o narzedziach i metodach komputerowych stosowanych w celu uzyskania odpowiedzi na pytania biologiczne | MS_2A_W01 | P2A_W03, P2A_W06 | C-1 | T-W-7, T-W-2, T-W-9, T-W-1, T-W-11, T-L-5, T-L-6, T-W-5, T-W-10, T-L-3, T-W-3, T-W-8, T-L-1, T-W-4, T-L-2, T-L-4, T-W-6 | M-2, M-1 | S-2, S-1, S-3 |
Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_U01 Potrafi tworzyć modele matematyczne pozwalające w precyzyjny sposób przewidzieć zachowania złożonych systemów biologicznych | MS_2A_U04, MS_2A_U07 | P2A_U01, P2A_U03, P2A_U04, P2A_U05 | C-2 | T-L-4, T-W-3, T-W-8, T-L-5, T-W-6, T-W-5, T-L-3, T-L-2, T-W-4, T-W-10, T-L-6, T-W-1, T-W-9, T-W-7, T-W-11, T-L-1, T-W-2 | M-1, M-2 | S-2, S-1 |
| MS_2A_PO4-1_U02 Jest zaznajomiony z bazami danych, sposobem ich funkcjonowania i wyszukiwania informacji | MS_2A_U04, MS_2A_U07 | P2A_U01, P2A_U03, P2A_U04, P2A_U05 | C-3 | T-W-4, T-L-2, T-L-4, T-L-6, T-L-5, T-W-7, T-W-5 | M-1, M-2 | S-3, S-2, S-1 |
Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_K01 Jest zorientowany na ciągłe rozszerzanie zdobytej wiedzy | MS_2A_K01 | P2A_K01, P2A_K05, P2A_K07 | C-1, C-2, C-3 | T-W-10, T-W-5, T-W-6, T-W-4, T-L-5, T-W-11, T-L-6, T-L-4, T-W-3, T-W-2, T-W-7, T-L-3, T-L-2, T-W-9, T-W-8, T-W-1, T-L-1 | M-2, M-1 | S-1 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_W01 Posiada wiedzę o narzedziach i metodach komputerowych stosowanych w celu uzyskania odpowiedzi na pytania biologiczne | 2,0 | |
| 3,0 | Student posiada zadowalającą wiedzę o narzedziach i metodach komputerowych stosowanych w celu uzyskania odpowiedzi na pytania biologiczne, ale z licznymi brakami | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_U01 Potrafi tworzyć modele matematyczne pozwalające w precyzyjny sposób przewidzieć zachowania złożonych systemów biologicznych | 2,0 | |
| 3,0 | Student w zadowalającym stopniu potrafi tworzyćmodele matematyczne pozwalające w precyzyjny sposób przewidzieć zachowania złożonych systemów biologicznych, ale z licznymi brakami | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| MS_2A_PO4-1_U02 Jest zaznajomiony z bazami danych, sposobem ich funkcjonowania i wyszukiwania informacji | 2,0 | |
| 3,0 | Student w zadowalającym stopniu jest zaznajomiony z bazami danych, sposobem ich funkcjonowania i wyszukiwania informacji, ale z licznymi brakami | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| MS_2A_PO4-1_K01 Jest zorientowany na ciągłe rozszerzanie zdobytej wiedzy | 2,0 | |
| 3,0 | Student w zadowalającym stopniu chce rozszerzać zdobytą wiedzę | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Baxevanisa A D, Ouellette'a, Bioinformatyka, PWN, Warszawa, 2005
- P.G. Higgs, T.K. Attwood, Bioinformatyka i ewolucja molekularna., PWN, 2008
Literatura dodatkowa
- Żródła internetowe podane przez prowadzącego, 2013