Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Zootechnika (N1)
specjalność: Hodowla i użytkowanie zwierząt
Sylabus przedmiotu Podstawy narzędzi bioinformatycznych i wprowadzenie do baz danych:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Zootechnika | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia niestacjonarne | Poziom | pierwszego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | inżynier | ||
| Obszary studiów | charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Podstawy narzędzi bioinformatycznych i wprowadzenie do baz danych | ||
| Specjalność | Pielęgniarstwo zwierząt | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Nauk o Zwierzętach Przeżuwających | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Sonia Hiller <Sonia.Hiller@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Inga Kowalewska <inga.kowalewska-luczak@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 2,0 | ECTS (formy) | 2,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | polski |
| Blok obieralny | 17 | Grupa obieralna | 4 |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Znajomość podstaw informatyki i genetyki ogólnej |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Zapoznanie studentów z bazami danych |
| C-2 | Przedstawienie projektowania badań molekularnych z użyciem narzędzi bioinformatycznych |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| T-A-1 | Przegląd baz danych z dostępem do zootechnicznych informacji naukowych | 1 |
| T-A-2 | Narzędzia informatyczne służące do wykonywania analiz in silico na sekwencjach nukleotydowych | 2 |
| T-A-3 | Projektowanie badań molekularnych in silico | 4 |
| 7 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Wprowadzenie do bioinformatyki | 2 |
| T-W-2 | Podstawy poruszania się w biologicznych bazach danych | 1 |
| T-W-3 | Przegląd narzędzi bioinfomatycznych | 2 |
| T-W-4 | Ogólnodostępne biologiczne bazy danych | 3 |
| 8 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| A-A-1 | Uczestnictwo w zajęciach | 7 |
| A-A-2 | Samodzielne studiowanie tematyki | 10 |
| A-A-3 | Przygotowanie do zaliczenia | 8 |
| 25 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Uczestnictwo w zajęciach | 8 |
| A-W-2 | Przygotowanie do zaliczenia | 11 |
| A-W-3 | Konsultacje | 6 |
| 25 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | Metoda podająca - wykład informacyjny wspomagany prezentacjami multimedialnymi |
| M-2 | Metoda praktyczna - pokaz |
| M-3 | Metoda praktyczna - ćwiczenia przedmiotowe |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: Zaliczenie pisemne |
| S-2 | Ocena formująca: Ocena aktywności na zajęciach |
| S-3 | Ocena formująca: Ocena bazująca na ocenie formującej |
Zamierzone efekty uczenia się - wiedza
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_W01 Student ma wiedzę dotyczącą biologicznych baz danych i wie w jaki sposób korzystać z różnych informacji zdobytych dzięki bazom danych, jak i wie jakie są dostępne narzędzia służące do projektowania badań z zakresu biologii molekularnych. | ZO_1A_W06 | — | — | C-1, C-2 | T-A-1, T-A-2, T-A-3, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4 | M-1, M-2 | S-1, S-2, S-3 |
Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_U01 Student posiada umiejętności dotyczące obsługi biologicznych baz danych i narzędzi bioinformatycznych służących do projektowania badań z zakresu biologii molekularnej. | ZO_1A_U04, ZO_1A_U05 | — | — | C-2 | T-A-1, T-A-2, T-A-3 | M-1, M-2, M-3 | S-1, S-2, S-3 |
Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_K01 Student potrafi wyszukiwać informacje dotyczące interesujących go zagadnień w bazach danych i na tej podstawie zaplanować projekt in silico analizy z zakresu biologii molekularnej | ZO_1A_K01, ZO_1A_K06 | — | — | C-1, C-2 | T-A-1, T-A-2, T-A-3, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4 | M-1, M-2, M-3 | S-1, S-2, S-3 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_W01 Student ma wiedzę dotyczącą biologicznych baz danych i wie w jaki sposób korzystać z różnych informacji zdobytych dzięki bazom danych, jak i wie jakie są dostępne narzędzia służące do projektowania badań z zakresu biologii molekularnych. | 2,0 | |
| 3,0 | Student posiada podstawową wiedzę dotyczącą biologicznych baz danych i wie w jaki sposób korzystać z różnych informacji zdobytych dzięki bazom danych, jak i wie jakie są posiada wiedzę na temat narzędzi do projektowania badań z zakresu biologiii molekularnej. | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_U01 Student posiada umiejętności dotyczące obsługi biologicznych baz danych i narzędzi bioinformatycznych służących do projektowania badań z zakresu biologii molekularnej. | 2,0 | |
| 3,0 | Student posiada podstawowe umiejętności dotyczące obsługi biologicznych baz danych i narzędzi bioinformatycznych służących do projektowania badań z zakresu biologii molekularnej. | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| ZO_1A_ZPN1O17.6_K01 Student potrafi wyszukiwać informacje dotyczące interesujących go zagadnień w bazach danych i na tej podstawie zaplanować projekt in silico analizy z zakresu biologii molekularnej | 2,0 | |
| 3,0 | Student wykazuje się podstawowymi umiejętnościami wyszukiwania informacji dotyczących interesujących go zagadnień w bazach danych i na tej podstawie zaplanować projekt in silico analizy z zakresu biologii molekularnej | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Lesk Arthur, Wprowadzenie do bioinformatyki, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2020
- Higgs Paul G., Attwood Teresa K., Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2013