Administracja Centralna Uczelni - Wymiana międzynarodowa (S2)
Sylabus przedmiotu Molecular Modeling of Enzymes:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Wymiana międzynarodowa | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | |||
| Obszary studiów | — | ||
| Profil | |||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Molecular Modeling of Enzymes | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Mikrobiologii i Biotechnologii | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Radosław Drozd <Radoslaw.Drozd@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | |||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | angielski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Knowledge of organic and inorganic chemistry, biochemistry, biophysics, English at intermediate level, |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Developing skills for selection of appropriate tools to solve and analyze the structure of enzymes |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Analysis of enzymes structural properities by molecular modeling software | 6 |
| T-L-2 | Prediction of tretairy structure of alpha - amylase form A. niger | 4 |
| T-L-3 | Modeling of catalytic properities of alpha - amylase from A. niger | 5 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Methods and source of obtaining information about the structure of enzymes | 1 |
| T-W-2 | Methods of functional analysis of the primary structure of enzymes | 2 |
| T-W-3 | Methods of prediction and analyze the secondary structure of enzymes | 2 |
| T-W-4 | In silico methods to prediction and analyze the tretiary structure of enzymes | 6 |
| T-W-5 | Methods for prediction and modeling functional properities of enzymes | 4 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | Participation in laboratory classes | 15 |
| A-L-2 | Project preparation | 13 |
| A-L-3 | Reading and analysis of specialised literature | 10 |
| 38 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Parcypitation in lectures | 15 |
| A-W-2 | Reading and analysis of specialised literature | 15 |
| A-W-3 | Analysis of scientific articles indicated by the teacher | 8 |
| 38 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | lectures |
| M-2 | disscusion |
| M-3 | laboratory lectures |
| M-4 | preparation of project |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: projekt |
| S-2 | Ocena podsumowująca: projekt |
Zamierzone efekty uczenia się - wiedza
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_W01 Student has knowledge about enzyme molecular structure organisation principles and methods of its analysis, determination and modification with use a bioinformatics tools. | — | — | C-1 | T-W-4, T-W-2, T-W-5, T-W-3, T-W-1 | M-4, M-3, M-1, M-2 | S-2, S-1 |
Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_U01 Student choose and apply correctly a molecular modeling tools for enzyme structure analysis and designing | — | — | C-1 | T-W-4, T-W-2, T-W-5, T-W-3, T-W-1 | M-4, M-3, M-1 | S-2, S-1 |
Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_K01 Student know and understand a consequences of modifications of the enzyme native structure | — | — | C-1 | T-L-2, T-L-3, T-L-1, T-W-4, T-W-2, T-W-5, T-W-3, T-W-1 | M-4, M-3, M-1, M-2 | S-2, S-1 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_W01 Student has knowledge about enzyme molecular structure organisation principles and methods of its analysis, determination and modification with use a bioinformatics tools. | 2,0 | |
| 3,0 | Preparation of molecular modeling project in base of indicated enzyme primary structure | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_U01 Student choose and apply correctly a molecular modeling tools for enzyme structure analysis and designing | 2,0 | |
| 3,0 | Preparation of molecular modeling project in base of indicated enzyme primary structure | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_K01 Student know and understand a consequences of modifications of the enzyme native structure | 2,0 | |
| 3,0 | Preparation on indicated time a project report | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Huzefa Rangwala, George Karypis, Introduction to Protein Structure Prediction: Methods and Algorithms, 2010
- Allan Svendsen, Enzyme Functionality: Design, Engineering and Screening, 2004
- Christoph Wittmann i Rainer Krull red., Biosystems Engineering I: Creating Superior Biocatalysts, Tom 1, Springer, 2010
- Arieh Warshel, Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions, Wiley, 1997
Literatura dodatkowa
- Athel Cornish-Bowden, Fundamentals of Enzyme Kinetics, Portland Press, Londyn, 2002, III