Administracja Centralna Uczelni - Wymiana międzynarodowa (S2)
Sylabus przedmiotu Protéomique:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Wymiana międzynarodowa | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | |||
| Obszary studiów | — | ||
| Profil | |||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Protéomique | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Fizjologii, Cytobiologii i Proteomiki | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Małgorzata Ożgo <Malgorzata.Ozgo@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Agnieszka Herosimczyk <Agnieszka.Herosimczyk@zut.edu.pl>, Adam Lepczyński <Adam.Lepczynski@zut.edu.pl>, Małgorzata Ożgo <Malgorzata.Ozgo@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | francuski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | la connaissance de la biochimie, de la biologie moleculaire, la genetique |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | La Protéomique a pour objectif la formation d’étudiants capables d’identifier et/ou de déterminer la structure de molécules biologiques simples ou complexes de toute nature (protéine, acide nucléiques, lipides), soit dans le cadre d’une démarche analytique, soit dans le cadre d’une démarche d’analyse globale du métabolisme. |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Electrophorèse en gel de polyacrylamide contenant du dodécylsulfate de sodium (SDS-PAGE), le principe et les applications de l'électrophorèse sur gel natif PAGE. Electrophorèse bidimensionnelle (2-DE) – principe de la méthode, préparation des échantillons pour la 2-DE, bandes d'IPG (IPG strips), focalisation isoélectrique. | 4 |
| T-L-2 | Méthodes de détection des protéines: coloration au Bleu de Coomassie, coloration à l'argent, coloration inverse avec des ions (cuivre, zinc), autoradiographie, fluorographie, coloration fluorescente. Analyse différentielle sur un gel unique (two-dimensional difference in gel electrophoresis 2D-DIGE) – principe et applications de la méthode. Acquisition d'image et analyse de gels 1D et 2D. Logiciels d'analyse des gels 1D et 2D. | 4 |
| T-L-3 | Utilisation pratique du MS MALDI-TOF (spectromètre de masse matrix-assisted laser desorption/ionisation time of flight) pour l'identification de protéines | 7 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Introduction à la protéomique. Importance biologique des modifications post-transcriptionnelles et post-translationnelles des protéines. Organisation du protéome. Les principes généraux de l'analyse protéomique. Techniques de séparation des protéines basées sur gel. Les composants de la matrice du gel de séparation. | 4 |
| T-W-2 | Applications de la spectrométrie de masse (MS) pour l'identification des protéines. Méthodes d'ionisation en spectrométrie de masse. Types d'analyseurs de masse. Cartographie peptidique massique (peptide mass fingerprinting PMF). Méthodes chromatographiques pour la séparation des protéines. Chromatographie en phase liquide (LC). Chromatographie liquide bidimensionnelle (2D LC). Les stratégies protéomiques basées sur la chromatographie liquide : LC-MS, LC-MS/MS, LC-MS/MS multidimensionnelle. Chromatographie d'affinité. Types de protéomique : structurelle, fonctionnelle et clinique. | 7 |
| T-W-3 | Techniques de séparation des protéines basées sur gel. | 4 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | participation en classe | 15 |
| A-L-2 | préparation pour les classes | 5 |
| A-L-3 | consultations | 5 |
| A-L-4 | étude de la litérrature recommandée | 8 |
| A-L-5 | préparation du protocol | 5 |
| 38 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | participation en classe | 15 |
| A-W-2 | étude de la litérrature recommandée | 12 |
| A-W-3 | consultations | 9 |
| A-W-4 | test écrit | 2 |
| 38 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | présntation oral |
| M-2 | travaux pratiques |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: test écrit |
| S-2 | Ocena formująca: preparation raport |
Zamierzone efekty uczenia się - wiedza
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_W01 l'élève peut énumérer et décrire les techniques couramment utilisées dans l'étude des protéines | — | — | C-1 | T-W-1, T-W-2, T-W-3 | M-1 | S-1 |
Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_U01 l'étudiant est capable d'utiliser des techniques protéomiques communément connues comme: MALDI TOF, Western Bloting, 2DE | — | — | C-1 | T-L-2, T-L-1, T-L-3 | M-2 | S-2 |
| WM-WBiHZ_2-_null_U02 l'étudiant est capable d'utiliser des techniques protéomiques communément connues comme: MALDI-TOF, 2DE, Western Bloting | — | — | C-1 | T-L-2, T-L-1, T-L-3 | M-2, M-1 | S-2 |
Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty uczenia się | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_K01 L'étudiant est conscient qu'il existe un certain nombre de méthodes pour analyser les différents niveaux de protéines en réponse à diverses stimulations physiologiques dans le matériel biologique. | — | — | C-1 | T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-L-2, T-L-1, T-L-3 | M-1 | S-2 |
| WM-WBiHZ_2-_null_K02 L'étudiant est conscient qu'il existe un certain nombre de méthodes pour analyser les différents niveaux de protéines en réponse à diverses stimulations physiologiques dans le matériel biologique | — | — | C-1 | T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-L-2, T-L-1, T-L-3 | M-2 | S-2 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_W01 l'élève peut énumérer et décrire les techniques couramment utilisées dans l'étude des protéines | 2,0 | |
| 3,0 | l'étudiant a une connaissance de base dans le cadre du programme matériel les étudiants ont une faible attitude vis-à-vis des connaissances dans le cadre de l'expression des connaissances, l'étudiant fait beaucoup d'erreurs | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_U01 l'étudiant est capable d'utiliser des techniques protéomiques communément connues comme: MALDI TOF, Western Bloting, 2DE | 2,0 | |
| 3,0 | L'étudiant connaît la construction d'un spectromètre de masse Maldi tof | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| WM-WBiHZ_2-_null_U02 l'étudiant est capable d'utiliser des techniques protéomiques communément connues comme: MALDI-TOF, 2DE, Western Bloting | 2,0 | |
| 3,0 | L'étudiant connaît la construction d'un spectromètre de masse Maldi tof | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt uczenia się | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| WM-WBiHZ_2-_null_K01 L'étudiant est conscient qu'il existe un certain nombre de méthodes pour analyser les différents niveaux de protéines en réponse à diverses stimulations physiologiques dans le matériel biologique. | 2,0 | |
| 3,0 | l'étudiant est capable d'indiquer la méthode appropriée d'identification et d'analyse des protéines | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 | ||
| WM-WBiHZ_2-_null_K02 L'étudiant est conscient qu'il existe un certain nombre de méthodes pour analyser les différents niveaux de protéines en réponse à diverses stimulations physiologiques dans le matériel biologique | 2,0 | |
| 3,0 | l'étudiant est capable d'indiquer la méthode appropriée d'identification et d'analyse des protéines | |
| 3,5 | ||
| 4,0 | ||
| 4,5 | ||
| 5,0 |
Literatura podstawowa
- Sheehan D., Tyther R. (Ed.)., Two-dimensional electrophoresis protocols, Humana Press, New York, 2009
- Garfin D., Ahuja S. (Ed.)., Handbook of isoelectric focusing and proteomics., Elsevier Academic Press, Amsterdam, 2005
- Walker J.M., The proteomics protocols handbook, Humana Press, New Jersey, 2002
Literatura dodatkowa
- Rabilloud T., Proteome research: two-dimensional gel electrophoresis and identification methods, Springer, Berlin, 2002