Administracja Centralna Uczelni - Wymiana międzynarodowa (S2)
Sylabus przedmiotu Protéomique:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Wymiana międzynarodowa | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | |||
| Obszary studiów | — | ||
| Profil | |||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Protéomique | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Fizjologii, Cytobiologii i Proteomiki | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Małgorzata Ożgo <Malgorzata.Ozgo@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Agnieszka Herosimczyk <Agnieszka.Herosimczyk@zut.edu.pl>, Adam Lepczyński <Adam.Lepczynski@zut.edu.pl>, Małgorzata Ożgo <Malgorzata.Ozgo@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 4,0 | ECTS (formy) | 4,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | francuski |
| Blok obieralny | — | Grupa obieralna | — |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | la connaissance de la biochimie, de la biologie moleculaire, la genetique |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | La Protéomique a pour objectif la formation d’étudiants capables d’identifier et/ou de déterminer la structure de molécules biologiques simples ou complexes de toute nature (protéine, acide nucléiques, lipides), soit dans le cadre d’une démarche analytique, soit dans le cadre d’une démarche d’analyse globale du métabolisme. |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Electrophorèse en gel de polyacrylamide contenant du dodécylsulfate de sodium (SDS-PAGE), le principe et les applications de l'électrophorèse sur gel natif PAGE. Electrophorèse bidimensionnelle (2-DE) – principe de la méthode, préparation des échantillons pour la 2-DE, bandes d'IPG (IPG strips), focalisation isoélectrique. | 4 |
| T-L-2 | Méthodes de détection des protéines: coloration au Bleu de Coomassie, coloration à l'argent, coloration inverse avec des ions (cuivre, zinc), autoradiographie, fluorographie, coloration fluorescente. Analyse différentielle sur un gel unique (two-dimensional difference in gel electrophoresis 2D-DIGE) – principe et applications de la méthode. Acquisition d'image et analyse de gels 1D et 2D. Logiciels d'analyse des gels 1D et 2D. | 4 |
| T-L-3 | Utilisation pratique du MS MALDI-TOF (spectromètre de masse matrix-assisted laser desorption/ionisation time of flight) pour l'identification de protéines | 7 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Introduction à la protéomique. Importance biologique des modifications post-transcriptionnelles et post-translationnelles des protéines. Organisation du protéome. Les principes généraux de l'analyse protéomique. Techniques de séparation des protéines basées sur gel. Les composants de la matrice du gel de séparation. | 4 |
| T-W-2 | Applications de la spectrométrie de masse (MS) pour l'identification des protéines. Méthodes d'ionisation en spectrométrie de masse. Types d'analyseurs de masse. Cartographie peptidique massique (peptide mass fingerprinting PMF). Méthodes chromatographiques pour la séparation des protéines. Chromatographie en phase liquide (LC). Chromatographie liquide bidimensionnelle (2D LC). Les stratégies protéomiques basées sur la chromatographie liquide : LC-MS, LC-MS/MS, LC-MS/MS multidimensionnelle. Chromatographie d'affinité. Types de protéomique : structurelle, fonctionnelle et clinique. | 7 |
| T-W-3 | Techniques de séparation des protéines basées sur gel. | 4 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | participation en classe | 15 |
| A-L-2 | préparation pour les classes | 15 |
| A-L-3 | consultations | 15 |
| A-L-4 | étude de la litérrature recommandée | 20 |
| A-L-5 | préparation du protocol | 10 |
| 75 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | participation en classe | 15 |
| A-W-2 | étude de la litérrature recommandée | 30 |
| A-W-3 | consultations | 28 |
| A-W-4 | test écrit | 2 |
| 75 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | présntation oral |
| M-2 | travaux pratiques |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: test écrit |
Literatura podstawowa
- Sheehan D., Tyther R. (Ed.)., Two-dimensional electrophoresis protocols, Humana Press, New York, 2009
- Garfin D., Ahuja S. (Ed.)., Handbook of isoelectric focusing and proteomics., Elsevier Academic Press, Amsterdam, 2005
- Walker J.M., The proteomics protocols handbook, Humana Press, New Jersey, 2002
Literatura dodatkowa
- Rabilloud T., Proteome research: two-dimensional gel electrophoresis and identification methods, Springer, Berlin, 2002