Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biologia (S2)
specjalność: Biologia molekularna i podstawy analityki
Sylabus przedmiotu Modelowanie molekularne białek i leków:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Biologia | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | drugiego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | magister | ||
| Obszary studiów | nauki przyrodnicze | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Modelowanie molekularne białek i leków | ||
| Specjalność | Biologia molekularna i podstawy analityki | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Immunologii, Mikrobiologii i Chemii Fizjologicznej | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Radosław Drozd <Radoslaw.Drozd@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | |||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | polski |
| Blok obieralny | 8 | Grupa obieralna | 3 |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Podstawy, chemii nieorganicznej i organicznej, biochemii, biofizyki, język angielski w stopniu średnio zaawansowanym |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Student poznaje metody rowiązywania struktur białkowych jako podstawę do badania interakcji między nimi a ligandami mogącymi mieć działanie terapeutyczne. Zdobywa zdolnośc doboru narzędzi do badania in silco samych białek i ich powiązań z innymi białkami w szlakach metabolicznych oraz czynników nie białkowych wpływających na ich aktywnosć i rodzaj interakcji między nimi. |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| T-A-1 | Chemiczne i strukturalne własciwości aminokwasów | 2 |
| T-A-2 | Czynniki wpływające na własciwości obszarów regulatorowych i katalitycznych biomolekuł | 4 |
| T-A-3 | Serwisy internetowe do predykcji kolejnych poziomów organizacji białek - metaserwery | 4 |
| T-A-4 | Ewaluacja procesu modelowania molekularnego | 2 |
| T-A-5 | Optymalizacja oddziaływań białko - ligand | 3 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Organizcja struktury białek | 2 |
| T-W-2 | Metody rozwiązywania struktury białek | 4 |
| T-W-3 | Funkcjonalne modelowanie struktur białkowych | 2 |
| T-W-4 | Metody modelowania cząstek aktywnych biologicznie | 2 |
| T-W-5 | Metody badania oddziaływań białko-ligand | 4 |
| T-W-6 | Testowanie in vitro i in vivo nowych farmacełtyków | 1 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| ćwiczenia audytoryjne | ||
| A-A-1 | uczestnictwo w zajęciach | 15 |
| A-A-2 | przygotowanie się do zajęć audytoryjnych | 10 |
| A-A-3 | przygotowanie się do kolokwium | 15 |
| A-A-4 | czytanie wskazanej literatury | 5 |
| 45 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | uczestnictwo w zajęciach | 15 |
| A-W-2 | czytanie wskazanej literatury | 20 |
| A-W-3 | Udział w konsultacjach | 5 |
| A-W-4 | Przygotowanie się do zaliczenia | 5 |
| 45 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | wykład informacyjny |
| M-2 | wykład problemowy |
| M-3 | film |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena podsumowująca: kolokwium |
Zamierzone efekty kształcenia - wiedza
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BL_2A_BLM-S-O5.4_W01 student zdobywa wiedzę o istocie odziaływań molekularnych, metodach ich badania, przewidywania następstw wzajemnych interakcji oraz możliwosći ich modelowania. | BL_2A_W03, BL_2A_W16 | — | C-1 | T-A-1, T-A-2, T-A-5, T-A-3, T-A-4, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6 | M-2, M-1, M-3 | S-1 |
Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BL_2A_BLM-S-O5.4_U01 umie dobierać narzdzia i metody do badania insilico oddziaływań molekularnych oraz struktury biomolekół | BL_2A_U07 | — | C-1 | T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6 | M-2, M-1, M-3 | S-1 |
Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BL_2A_BLM-S-O5.4_K01 rozumie złożoność systemów molekularnych i potrafi wykorzystywać posiadaną wiedzę do rozwiązywania złożonych problemów o podłożu biologicznym | BL_2A_K01 | — | C-1 | T-A-1, T-A-2, T-A-5, T-A-3, T-A-4, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5, T-W-6 | M-2, M-1, M-3 | S-1 |
Literatura podstawowa
- Baryszewskia M., Leyko W, Biofizyka dla biologów, PWN, Warszawa, 1997
- Higgs P.G., Attwood T.K, Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, Warszawa, 2008
- Höltje H-D., Sippl W., Rognan D., Folkers G, Molecular modeling, basic brinciples and applications, Wiley-VCH, Weinheim, 2008
- Oliver Kayser, Podstawy biotechnologii farmaceutycznej, Wydawnicto Uniwersyteu Jagielońskiego, Kraków, 2006
Literatura dodatkowa
- Oliver Kayser, Rainer H. Muller, Biotechnologia farmaceutyczna, PZWL, Warszawa, 2003
- Kononowicz K. (red), Wybrane zagadnienia z metod poszukiwania i otrzymywania środków leczniczych, Wydawnictwo Uniwersytetu Jagielońskiego, Kraków, 2006