Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Bioinformatyka (S1)
specjalność: Systemy informatyczne w biologii
Sylabus przedmiotu Zastosowanie technik komputerowych w alternatywnych metodach badań na zwierzętach:
Informacje podstawowe
| Kierunek studiów | Bioinformatyka | ||
|---|---|---|---|
| Forma studiów | studia stacjonarne | Poziom | pierwszego stopnia |
| Tytuł zawodowy absolwenta | inżynier | ||
| Obszary studiów | nauk przyrodniczych, nauk technicznych, studiów inżynierskich | ||
| Profil | ogólnoakademicki | ||
| Moduł | — | ||
| Przedmiot | Zastosowanie technik komputerowych w alternatywnych metodach badań na zwierzętach | ||
| Specjalność | przedmiot wspólny | ||
| Jednostka prowadząca | Katedra Hodowli Trzody Chlewnej, Żywienia Zwierząt i Żywności | ||
| Nauczyciel odpowiedzialny | Beata Matysiak <Beata.Matysiak@zut.edu.pl> | ||
| Inni nauczyciele | Kazimierz Bobko <Kazimierz.Bobko@zut.edu.pl> | ||
| ECTS (planowane) | 3,0 | ECTS (formy) | 3,0 |
| Forma zaliczenia | zaliczenie | Język | polski |
| Blok obieralny | 8 | Grupa obieralna | 4 |
Formy dydaktyczne
Wymagania wstępne
| KOD | Wymaganie wstępne |
|---|---|
| W-1 | Zastosowanie zwierząt do badań |
| W-2 | Dobrostan zwierząt doświadczalnych i laboratoryjnych |
Cele przedmiotu
| KOD | Cel modułu/przedmiotu |
|---|---|
| C-1 | Przedstawienie niezbędnej wiedzy z zakresu rozwijania alternatywnych metod, poprzez zastosowanie technik komputerowych, które mogą ograniczyć liczbę badań z udziałem żywych zwierząt. |
| C-2 | Przedstawienie przesłanek skłaniających do konieczności wykorzystywania najnowszych zdobyczy technicznych w doświadczeniach biomedycznych i dydaktyce. |
Treści programowe z podziałem na formy zajęć
| KOD | Treść programowa | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| T-L-1 | Rozwój metod alternatywnych jako możliwość ograniczenia wykorzystywania zwierząt w pracach badawczych z dziedziny nauk biomedycznych i biologicznych. | 2 |
| T-L-2 | Dane statystyczne w kształtowaniu liczby zwierząt doświadczalnych i laboratoryjnych z uwzględnieniem gatunków zwierząt oraz stopnia inwazyjności badań. | 2 |
| T-L-3 | Wykorzystanie danych epidemiologicznych w światowych bazach komputerowych | 2 |
| T-L-4 | Przegląd i zapoznanie z programami komputerowymi symulującymi działanie leku i anestetyków na określony układ. | 2 |
| T-L-5 | Banki tkanek i komórek (CBTiMG, Guz Biobank) | 2 |
| T-L-6 | Modele MD- PVC-Rat, Koken i symulatory multimedialne w zdobywaniu umiejętności manualnych i praktycznych | 2 |
| T-L-7 | Porównanie in silico i in vitro w badaniach metabolicznych. Komputerowe wspomaganie badania leków, badań klinicznych, techniki szybkiej analizy parametrów fizjologicznych. Techniki komputerowe QSAR, QSPR, QSMR, QSTR w farmakokinetyce. | 2 |
| T-L-8 | podsumowaie i pisemne zaliczenie ćwiczeń | 1 |
| 15 | ||
| wykłady | ||
| T-W-1 | Metodyka przeprowadzania badań na żywych organizmach. | 2 |
| T-W-2 | Informatyka jako nauka wspierające badania naukowe. Równania regresji. | 2 |
| T-W-3 | Organizacje wspierające badania ograniczające udział zwierząt w eksperymentach Narzędzia informatyczne wykorzystywane w doświadczeniach biologicznych i dydaktyce. | 2 |
| T-W-4 | Podstawy teoretyczne metody QSAR. Techniki komputerowe QSAR, QSPR, QSMR, QSTR w farmakokinetyce. | 6 |
| T-W-5 | Wykorzystanie łączy internetowych w poszerzaniu umiejętności i wiedzy z zakresu badań nauk biomedycznych | 2 |
| T-W-6 | Podsumowanie wykładów i zaliczenie. | 1 |
| 15 | ||
Obciążenie pracą studenta - formy aktywności
| KOD | Forma aktywności | Godziny |
|---|---|---|
| laboratoria | ||
| A-L-1 | Uczestnictwao w ćwiczeniach | 15 |
| A-L-2 | cztanie wskazanej literatury | 10 |
| A-L-3 | przygotowanie do zajęć ćwiczeniowych | 10 |
| A-L-4 | Przygotowaie do zaliczenia | 10 |
| 45 | ||
| wykłady | ||
| A-W-1 | Uczestnictwo w wykładach | 15 |
| A-W-2 | Czytanie wskazanej literatury | 7 |
| A-W-3 | Samodzielne studiowanie tematyki wykładów | 7 |
| A-W-4 | Przygotowanie do zaliczenia wykładów | 8 |
| A-W-5 | Przygotowanie referatów w formie prezentacji z wybranych zagadnień | 8 |
| 45 | ||
Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne
| KOD | Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne |
|---|---|
| M-1 | Wykład informacyjny przy użyciu komputera |
| M-2 | Film dydaktyczny |
| M-3 | Wykład konwersatoryjny |
Sposoby oceny
| KOD | Sposób oceny |
|---|---|
| S-1 | Ocena formująca: Ocena samodzielnie przygotowanych przez studentów prezentacji |
| S-2 | Ocena podsumowująca: Ocena za zakończenie cyklu wykładów |
Zamierzone efekty kształcenia - wiedza
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_W01 student definiuje, rozumie i wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | BI_1A_W16 | P1A_W04, P1A_W07, T1A_W02, T1A_W03 | — | C-1, C-2 | T-W-2 | M-1, M-2, M-3 | S-1, S-2 |
Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_U01 Student umie wykorzystwywać dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | BI_1A_U11 | P1A_U05, P1A_U09, T1A_U01, T1A_U13, T1A_U16 | InzA_U03, InzA_U05, InzA_U08 | C-1, C-2 | T-W-1, T-W-4, T-W-5 | M-1, M-2 | S-1, S-2 |
Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne
| Zamierzone efekty kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów | Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia | Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera | Cel przedmiotu | Treści programowe | Metody nauczania | Sposób oceny |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_K01 Student jest zorientowany w możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | BI_1A_K02 | P1A_K01, P1A_K04 | — | C-1, C-2 | T-W-1, T-W-3 | M-1, M-2, M-3 | S-1 |
Kryterium oceny - wiedza
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_W01 student definiuje, rozumie i wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | 2,0 | student nie definiuje, nie rozumie i nie wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń |
| 3,0 | student definiuje ale w niewielkim zakresie wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | |
| 3,5 | student definiuje i wskazuje celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | |
| 4,0 | student definiuje, rozumie i potrafi wskazać na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | |
| 4,5 | student dokładnie definiuje, rozumie i wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń | |
| 5,0 | student dokładnie definiuje, rozumie i wskazuje na celowość wykorzystania technik i technologii informatycznych w badaniach zastępujących lub ograniczających liczbę zwierząt wykorzystywanych do doświadczeń i proponuje ciekawe rozwiązania |
Kryterium oceny - umiejętności
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_U01 Student umie wykorzystwywać dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | 2,0 | Student nie umie wykorzystwywać dostępnych technik informatycznych w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce |
| 3,0 | Student w niewielkim zakresie umie wykorzystwywać dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | |
| 3,5 | Student umie wykorzystwywać dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | |
| 4,0 | Student umie wykorzystwywać i dobierać dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | |
| 4,5 | Student umie wykorzystwywać i dobierać oraz łączyć dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce | |
| 5,0 | Student umie opracować, wykorzystwywać, dobierać oraz łączyć dostępne techniki informatyczne w celu ograniczenia liczby zwierząt wykorzystywanych do badań eksperymentalnych i w dydaktyce |
Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne
| Efekt kształcenia | Ocena | Kryterium oceny |
|---|---|---|
| BI_1A_BI-S-O5.3_K01 Student jest zorientowany w możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | 2,0 | Student nie jest zorientowany w możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt |
| 3,0 | Student w niewielkim zakresie jest zorientowany w możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | |
| 3,5 | Student jest zorientowany i raczej świadomy o możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | |
| 4,0 | Student jest zorientowany i świadomy o możliwościach zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | |
| 4,5 | Student jest zorientowany, świadomy i postrzega możliwości zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt | |
| 5,0 | Student jest kreatywny, zorientowany, świadomy i postrzega możliwości zastosowania technik informatycznych zastępujących zwierzęta w badaniach oraz etycznego traktowania zwierząt i otwarty na dalszy swój rozwój |
Literatura podstawowa
- Brylińska J., Kwiatkowska J., Zwierzęta laboratoryjne - metody hodowli i doświadczeń, Universitas, Kraków, 1996, I
- Sejm RP, Ustawa o doświadczeniach na zwierzętach, Dz.U.2005.33.289, Warszawa, 2005
- Katkiewicz M, Zwierzęta laboratoryjne - choroby i użytkowanie, SGGW, Warszawa, 1989
- Godawska E.., Pękala E, Kieć-Kononowicz K., Porównanie metabolizmu prazikwantelu in silico i in vitro. Prace eksperymentalne., Biotechnologia (68), 215–222, 2005, 68
Literatura dodatkowa
- Metody alternatywne dostępne w UE dla celów regulacyjnych., Część B Aneksu V do Dyrektywy 67/548/EC, EU, 2011
- Charls River, Supporting Science. Advances Research, Animallab, 2011, www.animalab.pl