ZUT - Krajowe Ramy Kwalifikacji / Rok 2012/2013 / Wydział Kształtowania Środowiska i Rolnictwa / Ochrona i kształtowanie środowiska (S3) / Sylabus przedmiotu - Filogenetyka – zasady i wykorzystanie filogenetycznej systematyki

Wydział Kształtowania Środowiska i Rolnictwa - Ochrona i kształtowanie środowiska (S3)

Sylabus przedmiotu Filogenetyka – zasady i wykorzystanie filogenetycznej systematyki:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Ochrona i kształtowanie środowiska
Forma studiów	studia stacjonarne	Poziom	trzeciego stopnia
Stopnień naukowy absolwenta	doktor
Obszary studiów	—
Profil
Moduł	—
Przedmiot	Filogenetyka – zasady i wykorzystanie filogenetycznej systematyki
Specjalność	przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca	Zakład Ochrony Roślin
Nauczyciel odpowiedzialny	Janusz Błaszkowski <Janusz.Blaszkowski@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele	Iwona Adamska <Iwona.Adamska@zut.edu.pl>
ECTS (planowane)	2,0	ECTS (formy)	2,0
Forma zaliczenia	zaliczenie	Język	polski
Blok obieralny	9	Grupa obieralna	2

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
konwersatoria	K	7	20	2,0	1,00	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Student posiada podstawowe wiadomości z zakresu genetyki.
W-2	Student posiada podstawowe wiadomości z zakresu botaniki i ochrony środowiska.
W-3	Student posiada podstawowe wiadomości z zakresu ekologii.

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Zapoznanie z celami i zasadami filogenetyki
C-2	Poznanie filogenetycznych hipotez.
C-3	Zapoznanie z metodami stosowanymi w badaniach filogenetycznych.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
konwersatoria
T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.	2
T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.	2
T-K-3	Koncepcje gatunku.	2
T-K-4	Takson naturalny.	2
T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.	2
T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.	2
T-K-7	Cechy i homologia.	2
T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.	2
T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.	2
T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.	2
		20

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
konwersatoria
A-K-1	uczestnictwo w zajęciach	20
A-K-2	studiowanie literatury	25
A-K-3	przygotowanie do zaliczenia przedmiotu	10
A-K-4	udział w zaliczeniu	2
A-K-5	konsultacje	3
		60

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Wykład konwersatoryjny z wykorzystaniem środków multimedialnych.
M-2	Dyskusja dydaktyczna.

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena podsumowująca: Zaliczenie w formie sprawdzianu podsumowującego wiedzę zdobytą w czasie zajęć
S-2	Ocena formująca: Ocena za udział w dyskusji.

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
OS_3A_C08-2_W02 Posiada wiedzę na temat nowoczesnych technik filogenetycznych stosowanych w systematyce organizmów i sposobów zastosowania osiagnięć badawczych w procesach technologicznych i produkcyjnych	OS_3A_W03, OS_3A_W05, OS_3A_W01	—	C-1, C-2, C-3	T-K-10, T-K-5, T-K-4, T-K-7, T-K-1, T-K-2, T-K-8, T-K-9, T-K-3, T-K-6	M-1, M-2	S-1, S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
OS_3A_C08-2_U01 Posiada umiejętność formułowania nowych koncepcji i określania problemów badawczych oraz dobierania do ich rozwiązania odpowiednich nowoczenych technik badawczych	OS_3A_U01	—	C-1, C-2, C-3	T-K-1, T-K-9, T-K-3, T-K-8, T-K-10, T-K-5, T-K-6, T-K-2, T-K-4, T-K-7	M-2, M-1	S-1, S-2
OS_3A_C08-2_U02 Posiada umiejętność poszukiwania i stosowania najnowocześniejszych technik filogenetycznych w systematyce organizmów	OS_3A_U05, OS_3A_U06	—	C-2, C-3, C-1	T-K-2, T-K-4, T-K-6, T-K-7, T-K-9, T-K-1, T-K-8, T-K-10, T-K-5, T-K-3	M-1, M-2	S-1, S-2

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
OS_3A_C08-2_K01 Ma świadomość i potrzebę samodoskonalenia się i dokształcania oraz rozwijania własnych umiejętności, a także wymiany obserwacji z innymi osobami tworzącymi wspólnotę naukową i zawodową. Jest otwarty na stosowanie nowoczesnych technologii w procesach badawczych.	OS_3A_K01, OS_3A_K04	—	C-2, C-3, C-1	T-K-10, T-K-1, T-K-8, T-K-3, T-K-6, T-K-4, T-K-7, T-K-2, T-K-5, T-K-9	M-1, M-2	S-1, S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
OS_3A_C08-2_W02 Posiada wiedzę na temat nowoczesnych technik filogenetycznych stosowanych w systematyce organizmów i sposobów zastosowania osiagnięć badawczych w procesach technologicznych i produkcyjnych	2,0
	3,0	posiada wiedzę na temat nowoczesnych technik stosowanych w systematyce organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
OS_3A_C08-2_U01 Posiada umiejętność formułowania nowych koncepcji i określania problemów badawczych oraz dobierania do ich rozwiązania odpowiednich nowoczenych technik badawczych	2,0
	3,0	Posiada umiejętność dobierania nowoczesnych technik badawczych do rozwiązania określonego problemu badawczego
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
OS_3A_C08-2_U02 Posiada umiejętność poszukiwania i stosowania najnowocześniejszych technik filogenetycznych w systematyce organizmów	2,0
	3,0	Posiada umiejętność poszukiwania informacji o najnowocześniejszych technikach stosowanych w systematyce organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
OS_3A_C08-2_K01 Ma świadomość i potrzebę samodoskonalenia się i dokształcania oraz rozwijania własnych umiejętności, a także wymiany obserwacji z innymi osobami tworzącymi wspólnotę naukową i zawodową. Jest otwarty na stosowanie nowoczesnych technologii w procesach badawczych.	2,0
	3,0	Ma świadomość i potrzebę dokształcania się i rozwijania własnych umiejetności, jest otwarty na nowoczesne technologie
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Literatura podstawowa

Hall B. G., Łatwe drzewa filogenetyczne. Poradnik użytkownika, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2008
Wiley E. O., Lieberman B. S., Phylogenetics. The theory of phylogenetic systematics., Wiley-Blackwell, 2011, 2nd ed.

Literatura dodatkowa

Winter P. C., Hickey G. I., Flechter H. L., Krótkie wykłady. Genetyka, PWN, Warszawa, 2008
Brown T. A., Genomy, PWN, Warszawa, 2001
Węgleński P., Genetyka molekularna, PWN, Warszawa, 2007
Żuk B., Wierzbicki H., Zatoń-Dobrowolska M., Genetyka populacji i metody hodowlane, PWRiL, 2011

Treści programowe - konwersatoria

KOD	Treść programowa	Godziny
T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.	2
T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.	2
T-K-3	Koncepcje gatunku.	2
T-K-4	Takson naturalny.	2
T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.	2
T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.	2
T-K-7	Cechy i homologia.	2
T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.	2
T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.	2
T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.	2
		20

Formy aktywności - konwersatoria

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-K-1	uczestnictwo w zajęciach	20
A-K-2	studiowanie literatury	25
A-K-3	przygotowanie do zaliczenia przedmiotu	10
A-K-4	udział w zaliczeniu	2
A-K-5	konsultacje	3
		60

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	OS_3A_C08-2_W02	Posiada wiedzę na temat nowoczesnych technik filogenetycznych stosowanych w systematyce organizmów i sposobów zastosowania osiagnięć badawczych w procesach technologicznych i produkcyjnych
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_W03	Wykazuje oryginalne i twórcze podejście do rozwiązywania problemów ochrony środowiska, produkcji roślinnej, ogrodniczej i inżynierii środowiska i wdrażania osiągnięć badań naukowych.
	OS_3A_W05	Ma zintegrowaną wiedzę pozwalającą na organizację badań naukowych, uwzględniających dobór odpowiednich metod, technik, technologii, narzędzi i materiałów prowadzących do zrównoważonego wykorzystania potencjału przyrody oraz poprawy jakości życia człowieka.
	OS_3A_W01	Ma wiedzę specjalistyczną z zakresu biologii, chemii, matematyki i fizyki pozwalającą na interpretację procesów fizycznych, chemicznych i biologicznych zachodzących w biosferze i środowisku abiotycznym.
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie z celami i zasadami filogenetyki
	C-2	Poznanie filogenetycznych hipotez.
	C-3	Zapoznanie z metodami stosowanymi w badaniach filogenetycznych.
Treści programowe	T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.
	T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.
	T-K-4	Takson naturalny.
	T-K-7	Cechy i homologia.
	T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.
	T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.
	T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.
	T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.
	T-K-3	Koncepcje gatunku.
	T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.
Metody nauczania	M-1	Wykład konwersatoryjny z wykorzystaniem środków multimedialnych.
Metody nauczania	M-2	Dyskusja dydaktyczna.
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Zaliczenie w formie sprawdzianu podsumowującego wiedzę zdobytą w czasie zajęć
Sposób oceny	S-2	Ocena formująca: Ocena za udział w dyskusji.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	posiada wiedzę na temat nowoczesnych technik stosowanych w systematyce organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	OS_3A_C08-2_U01	Posiada umiejętność formułowania nowych koncepcji i określania problemów badawczych oraz dobierania do ich rozwiązania odpowiednich nowoczenych technik badawczych
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_U01	Posiada umiejętność krytycznej analizy i oceny informacji, pozwalających na formułowanie nowych myśli i koncepcji.
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie z celami i zasadami filogenetyki
	C-2	Poznanie filogenetycznych hipotez.
	C-3	Zapoznanie z metodami stosowanymi w badaniach filogenetycznych.
Treści programowe	T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.
	T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.
	T-K-3	Koncepcje gatunku.
	T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.
	T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.
	T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.
	T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.
	T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.
	T-K-4	Takson naturalny.
	T-K-7	Cechy i homologia.
Metody nauczania	M-2	Dyskusja dydaktyczna.
Metody nauczania	M-1	Wykład konwersatoryjny z wykorzystaniem środków multimedialnych.
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Zaliczenie w formie sprawdzianu podsumowującego wiedzę zdobytą w czasie zajęć
Sposób oceny	S-2	Ocena formująca: Ocena za udział w dyskusji.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Posiada umiejętność dobierania nowoczesnych technik badawczych do rozwiązania określonego problemu badawczego
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	OS_3A_C08-2_U02	Posiada umiejętność poszukiwania i stosowania najnowocześniejszych technik filogenetycznych w systematyce organizmów
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_U05	Wykazuje się umiejętnością wykorzystania specyficz-nych technik przy opracowywaniu nowych technolo-gii prowadzących do zrównoważonego wykorzystania potencjału przyrody oraz jakości życia człowieka.
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_U06	Poszukuje nowych rozwiązań zaistniałych problemów naukowych i zawodowych.
Cel przedmiotu	C-2	Poznanie filogenetycznych hipotez.
	C-3	Zapoznanie z metodami stosowanymi w badaniach filogenetycznych.
	C-1	Zapoznanie z celami i zasadami filogenetyki
Treści programowe	T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.
	T-K-4	Takson naturalny.
	T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.
	T-K-7	Cechy i homologia.
	T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.
	T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.
	T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.
	T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.
	T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.
	T-K-3	Koncepcje gatunku.
Metody nauczania	M-1	Wykład konwersatoryjny z wykorzystaniem środków multimedialnych.
Metody nauczania	M-2	Dyskusja dydaktyczna.
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Zaliczenie w formie sprawdzianu podsumowującego wiedzę zdobytą w czasie zajęć
Sposób oceny	S-2	Ocena formująca: Ocena za udział w dyskusji.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Posiada umiejętność poszukiwania informacji o najnowocześniejszych technikach stosowanych w systematyce organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	OS_3A_C08-2_K01	Ma świadomość i potrzebę samodoskonalenia się i dokształcania oraz rozwijania własnych umiejętności, a także wymiany obserwacji z innymi osobami tworzącymi wspólnotę naukową i zawodową. Jest otwarty na stosowanie nowoczesnych technologii w procesach badawczych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_K01	Ma świadomość ważności dokształcania się i samodoskonalenia, a także potrafi inspirować i organizować proces uczenia się innych osób.
Odniesienie do efektów kształcenia dla dyscypliny	OS_3A_K04	Przyczynia się do podtrzymania i doskonalenia etosu wspólnoty naukowej i zawodowej.
Cel przedmiotu	C-2	Poznanie filogenetycznych hipotez.
	C-3	Zapoznanie z metodami stosowanymi w badaniach filogenetycznych.
	C-1	Zapoznanie z celami i zasadami filogenetyki
Treści programowe	T-K-10	Izolowanie, oczyszczanie, klonowanie i sekwencjonowanie DNA z grzybów.
	T-K-1	Organizmy i grupowanie organizmów.
	T-K-8	Okazy i ich przechowywanie.
	T-K-3	Koncepcje gatunku.
	T-K-6	Rodzaje drzew filogenetycznych.
	T-K-4	Takson naturalny.
	T-K-7	Cechy i homologia.
	T-K-2	Rodzaje filogenetycznych hipotez.
	T-K-5	Monofilogeneza, parafilogeneza i polifilogeneza.
	T-K-9	Publikowanie i zasady nomenklatury.
Metody nauczania	M-1	Wykład konwersatoryjny z wykorzystaniem środków multimedialnych.
Metody nauczania	M-2	Dyskusja dydaktyczna.
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Zaliczenie w formie sprawdzianu podsumowującego wiedzę zdobytą w czasie zajęć
Sposób oceny	S-2	Ocena formująca: Ocena za udział w dyskusji.
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Ma świadomość i potrzebę dokształcania się i rozwijania własnych umiejetności, jest otwarty na nowoczesne technologie
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0