ZUT - Krajowe Ramy Kwalifikacji / Rok 2012/2013 / Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt / Bioinformatyka (S1) / Systemy informatyczne w biologii / Sylabus przedmiotu - Ewolucjonizm i podstawy filogenetyki molekularnej

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Bioinformatyka (S1)
specjalność: Systemy informatyczne w biologii

Sylabus przedmiotu Ewolucjonizm i podstawy filogenetyki molekularnej:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów	Bioinformatyka
Forma studiów	studia stacjonarne	Poziom	pierwszego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta	inżynier
Obszary studiów	nauk przyrodniczych, nauk technicznych, studiów inżynierskich
Profil	ogólnoakademicki
Moduł	—
Przedmiot	Ewolucjonizm i podstawy filogenetyki molekularnej
Specjalność	Biologia systemów i metody informatyczne
Jednostka prowadząca	Katedra Zoologii i Pszczelnictwa
Nauczyciel odpowiedzialny	Wiesław Salicki <Wieslaw.Salicki@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele	Inga Kowalewska <inga.kowalewska-luczak@zut.edu.pl>
ECTS (planowane)	2,0	ECTS (formy)	2,0
Forma zaliczenia	zaliczenie	Język	polski
Blok obieralny	—	Grupa obieralna	—

Formy dydaktyczne

Forma dydaktyczna	KOD	Semestr	Godziny	ECTS	Waga	Zaliczenie
wykłady	W	6	15	1,0	0,59	zaliczenie
ćwiczenia audytoryjne	A	6	25	1,0	0,41	zaliczenie

Wymagania wstępne

KOD	Wymaganie wstępne
W-1	Wymagana wiedza z zakresu botaniki, zoologii, geologii
W-2	Znajomość podstaw z zakresu genetyki, genetyki molekularnej i biologii komórki.

Cele przedmiotu

KOD	Cel modułu/przedmiotu
C-1	Zapoznanie studentów z historią myśli ewolucyjnej i innymi poglądami na powstanie i rozwój życia, z mechanizmami ewolucji na różnych poziomach organizmu: populacji, gatunku, oraz ze zjawiskami makroewolucyjnymi i megaewolucyjnymi.
C-2	Przybliżenie studentom paleontologii. Wykształcenie umiejętności swobodnego poruszania się po historii naszej planety, przedstawiając chronologiczny opis jej dziejów ze szczególnym uwzględnieniem zjawisk towarzyszących powstawaniu i wymieraniu gatunków. Studenci powinni zdobyć umiejętność rozpoznawania i powiązania obecnie żyjących organizmów z ich przodkami.
C-3	Przedstawienie podstawowych pojęć z zakresu filogenetyki molekularnej. Zaprezentowanie drzew filogenetycznych i zegara molekularnego oraz możliwości ich wykorzystania w analizach.
C-4	Przedstawienie filogenezy molekularnej jako podstawy biologii porównawczej i ewolucyjnej.
C-5	Przedstawienie możliwości wykorzystywania filogenezy molekularnej w różnych dziedzinach nauki.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KOD	Treść programowa	Godziny
ćwiczenia audytoryjne
T-A-1	Podstawy paleontologii	4
T-A-2	Dzieje życia na Ziemi	6
T-A-3	Przegląd skamieniałości	3
T-A-4	Czynniki wpływające na ewolucję sekwencji nukleotydowych i ewolucję białek.	2
T-A-5	Metody i etapy konstrukcji drzew filogenetycznych.	4
T-A-6	Przegląd programów komputerowych do analiz filogenetycznych.	2
T-A-7	Zastosowanie analizy filogenetycznej i perspektywy wykorzystania w przyszłości.	4
		25
wykłady
T-W-1	Mechanizmy ewolucji na poziomie genetycznym	2
T-W-2	Mechanizmy ewolucji na poziomie populacji i gatunku	2
T-W-3	Makroewolucja	2
T-W-4	Megaewolucja	2
T-W-5	Podstawy filogenetyki molekularnej. Drzewa filogenetyczne.	2
T-W-6	Hipoteza „zegara molekularnego”.	2
T-W-7	Filogeneza jako podstawa biologii porównawczej i ewolucyjnej oraz paleontologia molekularna.	3
		15

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KOD	Forma aktywności	Godziny
ćwiczenia audytoryjne
A-A-1	uczestnictwo w zajęciach	25
A-A-2	Przygotowanie do sprawdzianów	5
		30
wykłady
A-W-1	uczestnictwo w zajęciach	15
A-W-2	Przygotowanie do sprawdzianu	7
A-W-3	Studiowanie zalecanej literatury	8
		30

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KOD	Metoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
M-2	Wykład problemowy z dyskusją

Sposoby oceny

KOD	Sposób oceny
S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
S-2	Ocena podsumowująca: ocena podsumowująca poszczególne moduły treści przedmiotu

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BI_1A_BIB-S-C7_W01 Student charakteryzuje mechanizmy ewolucyjne, które są przyczyną zmienności morfologiczno-anatomicznych i funkcjonalnych organizmów	BI_1A_W05	P1A_W01, P1A_W02, P1A_W05, P1A_W06, P1A_W07, T1A_W02, T1A_W04, T1A_W05, T1A_W07	InzA_W02	C-1	T-W-4, T-W-1, T-W-2, T-W-3	M-1	S-1
BI_1A_BIB-S-C7_W02 W wyniku przeprowadzoych zajęć student zna teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.	BI_1A_W05	P1A_W01, P1A_W02, P1A_W05, P1A_W06, P1A_W07, T1A_W02, T1A_W04, T1A_W05, T1A_W07	InzA_W02	C-3	T-W-5, T-W-6	M-1	S-1
BI_1A_BIB-S-C7_W03 W wyniku przeprowadzonych zajęć student ma wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.	BI_1A_W05	P1A_W01, P1A_W02, P1A_W05, P1A_W06, P1A_W07, T1A_W02, T1A_W04, T1A_W05, T1A_W07	InzA_W02	C-5, C-4	T-A-7	M-1, M-2	S-1

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BI_1A_BIB-S-C7_U01 Student objaśnia zróżnicowanie organizmów powstałe w wyniku ewolucji	BI_1A_U24	P1A_U02, P1A_U03, P1A_U07, P1A_U10, T1A_U01	—	C-2	T-A-2, T-A-3, T-A-1	M-2	S-2
BI_1A_BIB-S-C7_U02 W wyniku przeprwadzonych zajęć student konstruuje drzewo filogenetyczne wybranego gatunku.	BI_1A_U24	P1A_U02, P1A_U03, P1A_U07, P1A_U10, T1A_U01	—	C-3	T-A-5, T-A-4, T-A-6	M-1	S-2
BI_1A_BIB-S-C7_U03 W wyniku przeprowadzonych zajęć student analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.	BI_1A_U24	P1A_U02, P1A_U03, P1A_U07, P1A_U10, T1A_U01	—	C-5, C-4	T-W-7, T-A-7	M-2	S-1

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	Cel przedmiotu	Treści programowe	Metody nauczania	Sposób oceny
BI_1A_BIB-S-C7_K01 Student posiądzie świadomość relacji pomiędzy organizmami istniejącymi obecnie i w przeszłości opierając się na bazie empirycznej	BI_1A_K02	P1A_K01, P1A_K04	—	C-1, C-2	T-A-3, T-A-2, T-A-1, T-W-1, T-W-3, T-W-4, T-W-2	M-2, M-1	S-2, S-1
BI_1A_BIB-S-C7_K02 W wyniku przeprowadzonych zajęć student postrzega relacje między filogenetyką molekularną a innymi dziedzinami nauki	BI_1A_K03	P1A_K01, P1A_K02, P1A_K05, P1A_K07, P1A_K08, T1A_K01, T1A_K06, T1A_K07	InzA_K02	C-5	T-W-7, T-A-7	M-2	S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BI_1A_BIB-S-C7_W01 Student charakteryzuje mechanizmy ewolucyjne, które są przyczyną zmienności morfologiczno-anatomicznych i funkcjonalnych organizmów	2,0
	3,0	wykazanie się wiedzą na poziomie dostatecznym, na temat mechanizmów ewolucyjnych powodujących zmienność funkcjonowania organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BI_1A_BIB-S-C7_W02 W wyniku przeprowadzoych zajęć student zna teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.	2,0	Student nie zna teorii konstrukcji drzew filogenetycznych oraz nie ma wiedzy na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	3,0	Student zna teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	3,5	Student zna biegle teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	4,0	Student zna biegle teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma dobrą i ugruntowaną wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	4,5	Student zna doskonale teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma dobrą i ugruntowaną wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	5,0	Student zna doskonale teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma doskonałą wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
BI_1A_BIB-S-C7_W03 W wyniku przeprowadzonych zajęć student ma wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.	2,0	Student nie ma wiedzy z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,0	Student ma wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,5	Student ma ugruntowaną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	4,0	Student ma dobrą i ugruntowaną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	4,5	Student ma doskonałą wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	5,0	Student ma doskonałą podstawowa i rozszerzoną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BI_1A_BIB-S-C7_U01 Student objaśnia zróżnicowanie organizmów powstałe w wyniku ewolucji	2,0
	3,0	Umiejętność powiązania w stopniu dostatecznym zjawisk ewolucyjnych ze zróżnicowaniem organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BI_1A_BIB-S-C7_U02 W wyniku przeprwadzonych zajęć student konstruuje drzewo filogenetyczne wybranego gatunku.	2,0	Student nie umie skonstruować drzewa filogenetycznegomodelowych gatunków zwierząt.
	3,0	Student konstruuje drzewo filogentyczne modelowych gatunków zwierząt.
	3,5	Student biegle i poprawnie konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych gatunków zwierząt.
	4,0	Student biegle i poprawnie konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych i innych gatunków zwierząt.
	4,5	Student biegle i z wprawą konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych i innych gatunków zwierząt.
	5,0	Student doskonalekonstruuje drzewo filogenetyczne wybranego dowolnego gatunku zwierząt.
BI_1A_BIB-S-C7_U03 W wyniku przeprowadzonych zajęć student analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.	2,0	Student nie analizuje roli filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,0	Student analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	3,5	Student biegle analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	4,0	Student biegle analizuje i charakteryzuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	4,5	Student biegle analizuje, charakteryzuje i tłumaczy rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	5,0	Student dosonale analizuje, charakteryzuje i tłumaczy rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształcenia	Ocena	Kryterium oceny
BI_1A_BIB-S-C7_K01 Student posiądzie świadomość relacji pomiędzy organizmami istniejącymi obecnie i w przeszłości opierając się na bazie empirycznej	2,0
	3,0	Znajomość w stopniu dostatecznym ważnych ewolucyjnych zmian na przestrzeni dziejów Ziemi
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0
BI_1A_BIB-S-C7_K02 W wyniku przeprowadzonych zajęć student postrzega relacje między filogenetyką molekularną a innymi dziedzinami nauki	2,0	Student nie postrzega relacji między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	3,0	Student postrzega relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	3,5	Student postrzega i charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	4,0	Student postrzega i charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany na pogłębianie wiedzy.
	4,5	Student postrzega i biegle charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany na pogłębianie wiedzy.
	5,0	Student postrzega i biegle charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany i otwarty na pogłębianie wiedzy.

Literatura podstawowa

Krzanowska H., Łomnicki A., Zarys mechanizmów ewolucji, Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2002
Hall B., Łatwe drzewa filogenetyczne, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2008
Douglas F., Ewolucja, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2008
Higgs P.G., Attwood T.K., Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, Warszawa, 2008
Dzik J., Dzieje życia na Ziemi, Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2003

Literatura dodatkowa

Stanley S.M., Historia Ziemi, Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2002
Avise J.C., Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2008
Ryszkiewicz M., Ewolucja. Od wielkiego wybuchu do Homo sapiens, Prószyński i s-ka, Warszawa, 2000

Treści programowe - ćwiczenia audytoryjne

KOD	Treść programowa	Godziny
T-A-1	Podstawy paleontologii	4
T-A-2	Dzieje życia na Ziemi	6
T-A-3	Przegląd skamieniałości	3
T-A-4	Czynniki wpływające na ewolucję sekwencji nukleotydowych i ewolucję białek.	2
T-A-5	Metody i etapy konstrukcji drzew filogenetycznych.	4
T-A-6	Przegląd programów komputerowych do analiz filogenetycznych.	2
T-A-7	Zastosowanie analizy filogenetycznej i perspektywy wykorzystania w przyszłości.	4
		25

Treści programowe - wykłady

KOD	Treść programowa	Godziny
T-W-1	Mechanizmy ewolucji na poziomie genetycznym	2
T-W-2	Mechanizmy ewolucji na poziomie populacji i gatunku	2
T-W-3	Makroewolucja	2
T-W-4	Megaewolucja	2
T-W-5	Podstawy filogenetyki molekularnej. Drzewa filogenetyczne.	2
T-W-6	Hipoteza „zegara molekularnego”.	2
T-W-7	Filogeneza jako podstawa biologii porównawczej i ewolucyjnej oraz paleontologia molekularna.	3
		15

Formy aktywności - ćwiczenia audytoryjne

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-A-1	uczestnictwo w zajęciach	25
A-A-2	Przygotowanie do sprawdzianów	5
		30

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KOD	Forma aktywności	Godziny
A-W-1	uczestnictwo w zajęciach	15
A-W-2	Przygotowanie do sprawdzianu	7
A-W-3	Studiowanie zalecanej literatury	8
		30

(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_W01	Student charakteryzuje mechanizmy ewolucyjne, które są przyczyną zmienności morfologiczno-anatomicznych i funkcjonalnych organizmów
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_W05	opisuje budowę i funkcjonowanie organizmu na różnych poziomach organizacji oraz zróżnicowanie morfologiczno-anatomiczne i funkcjonalne na różnych etapach rozwoju i w toku ewolucji
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_W01	rozumie podstawowe zjawiska i procesy przyrodnicze
	P1A_W02	w interpretacji zjawisk i procesów przyrodniczych opiera się na podstawach empirycznych, rozumiejąc w pełni znaczenie metod matematycznych i statystycznych
	P1A_W05	ma wiedzę w zakresie podstawowych kategorii pojęciowych i terminologii przyrodniczej oraz ma znajomość rozwoju dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów i stosowanych w nich metod badawczych
	P1A_W06	ma wiedzę w zakresie statystyki i informatyki na poziomie pozwalającym na opisywanie i interpretowanie zjawisk przyrodniczych
	P1A_W07	ma wiedzę w zakresie podstawowych technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W02	ma podstawową wiedzę w zakresie kierunków studiów powiązanych ze studiowanym kierunkiem studiów
	T1A_W04	ma szczegółową wiedzę związaną z wybranymi zagadnieniami z zakresu studiowanego kierunku studiów
	T1A_W05	ma podstawową wiedzę o trendach rozwojowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W07	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA_W02	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie studentów z historią myśli ewolucyjnej i innymi poglądami na powstanie i rozwój życia, z mechanizmami ewolucji na różnych poziomach organizmu: populacji, gatunku, oraz ze zjawiskami makroewolucyjnymi i megaewolucyjnymi.
Treści programowe	T-W-4	Megaewolucja
	T-W-1	Mechanizmy ewolucji na poziomie genetycznym
	T-W-2	Mechanizmy ewolucji na poziomie populacji i gatunku
	T-W-3	Makroewolucja
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	wykazanie się wiedzą na poziomie dostatecznym, na temat mechanizmów ewolucyjnych powodujących zmienność funkcjonowania organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_W02	W wyniku przeprowadzoych zajęć student zna teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_W05	opisuje budowę i funkcjonowanie organizmu na różnych poziomach organizacji oraz zróżnicowanie morfologiczno-anatomiczne i funkcjonalne na różnych etapach rozwoju i w toku ewolucji
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_W01	rozumie podstawowe zjawiska i procesy przyrodnicze
	P1A_W02	w interpretacji zjawisk i procesów przyrodniczych opiera się na podstawach empirycznych, rozumiejąc w pełni znaczenie metod matematycznych i statystycznych
	P1A_W05	ma wiedzę w zakresie podstawowych kategorii pojęciowych i terminologii przyrodniczej oraz ma znajomość rozwoju dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów i stosowanych w nich metod badawczych
	P1A_W06	ma wiedzę w zakresie statystyki i informatyki na poziomie pozwalającym na opisywanie i interpretowanie zjawisk przyrodniczych
	P1A_W07	ma wiedzę w zakresie podstawowych technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W02	ma podstawową wiedzę w zakresie kierunków studiów powiązanych ze studiowanym kierunkiem studiów
	T1A_W04	ma szczegółową wiedzę związaną z wybranymi zagadnieniami z zakresu studiowanego kierunku studiów
	T1A_W05	ma podstawową wiedzę o trendach rozwojowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W07	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA_W02	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-3	Przedstawienie podstawowych pojęć z zakresu filogenetyki molekularnej. Zaprezentowanie drzew filogenetycznych i zegara molekularnego oraz możliwości ich wykorzystania w analizach.
Treści programowe	T-W-5	Podstawy filogenetyki molekularnej. Drzewa filogenetyczne.
Treści programowe	T-W-6	Hipoteza „zegara molekularnego”.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie zna teorii konstrukcji drzew filogenetycznych oraz nie ma wiedzy na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	3,0	Student zna teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	3,5	Student zna biegle teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	4,0	Student zna biegle teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma dobrą i ugruntowaną wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	4,5	Student zna doskonale teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma dobrą i ugruntowaną wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.
	5,0	Student zna doskonale teorie konstrukcji drzew filogenetycznych oraz ma doskonałą wiedzę na temat odniesienia filogenetyki molekularnej i systematyki klasycznej.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_W03	W wyniku przeprowadzonych zajęć student ma wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_W05	opisuje budowę i funkcjonowanie organizmu na różnych poziomach organizacji oraz zróżnicowanie morfologiczno-anatomiczne i funkcjonalne na różnych etapach rozwoju i w toku ewolucji
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_W01	rozumie podstawowe zjawiska i procesy przyrodnicze
	P1A_W02	w interpretacji zjawisk i procesów przyrodniczych opiera się na podstawach empirycznych, rozumiejąc w pełni znaczenie metod matematycznych i statystycznych
	P1A_W05	ma wiedzę w zakresie podstawowych kategorii pojęciowych i terminologii przyrodniczej oraz ma znajomość rozwoju dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów i stosowanych w nich metod badawczych
	P1A_W06	ma wiedzę w zakresie statystyki i informatyki na poziomie pozwalającym na opisywanie i interpretowanie zjawisk przyrodniczych
	P1A_W07	ma wiedzę w zakresie podstawowych technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W02	ma podstawową wiedzę w zakresie kierunków studiów powiązanych ze studiowanym kierunkiem studiów
	T1A_W04	ma szczegółową wiedzę związaną z wybranymi zagadnieniami z zakresu studiowanego kierunku studiów
	T1A_W05	ma podstawową wiedzę o trendach rozwojowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_W07	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA_W02	zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotu	C-5	Przedstawienie możliwości wykorzystywania filogenezy molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
Cel przedmiotu	C-4	Przedstawienie filogenezy molekularnej jako podstawy biologii porównawczej i ewolucyjnej.
Treści programowe	T-A-7	Zastosowanie analizy filogenetycznej i perspektywy wykorzystania w przyszłości.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
Metody nauczania	M-2	Wykład problemowy z dyskusją
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie ma wiedzy z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,0	Student ma wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,5	Student ma ugruntowaną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	4,0	Student ma dobrą i ugruntowaną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	4,5	Student ma doskonałą wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	5,0	Student ma doskonałą podstawowa i rozszerzoną wiedzę z zakresu roli i zastosowania filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_U01	Student objaśnia zróżnicowanie organizmów powstałe w wyniku ewolucji
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_U24	na podstawie znajomości procesów ewolucyjnych oraz rozwoju filo- i ontogenetycznego interpretuje i wyjaśnia podobieństwa oraz zróżnicowanie między organizmami
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_U02	rozumie literaturę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów w języku polskim; czyta ze zrozumieniem nieskomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
	P1A_U03	wykorzystuje dostępne źródła informacji, w tym źródła elektroniczne
	P1A_U07	wykazuje umiejętność poprawnego wnioskowania na podstawie danych pochodzących z różnych źródeł
	P1A_U10	posiada umiejętność wystąpień ustnych w języku polskim i języku obcym, dotyczących zagadnień szczegółowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_U01	potrafi pozyskiwać informacje z literatury, baz danych oraz innych właściwie dobranych źródeł, także w języku angielskim lub innym języku obcym uznawanym za język komunikacji międzynarodowej w zakresie studiowanego kierunku studiów; potrafi integrować uzyskane informacje, dokonywać ich interpretacji, a także wyciągać wnioski oraz formułować i uzasadniać opinie
Cel przedmiotu	C-2	Przybliżenie studentom paleontologii. Wykształcenie umiejętności swobodnego poruszania się po historii naszej planety, przedstawiając chronologiczny opis jej dziejów ze szczególnym uwzględnieniem zjawisk towarzyszących powstawaniu i wymieraniu gatunków. Studenci powinni zdobyć umiejętność rozpoznawania i powiązania obecnie żyjących organizmów z ich przodkami.
Treści programowe	T-A-2	Dzieje życia na Ziemi
	T-A-3	Przegląd skamieniałości
	T-A-1	Podstawy paleontologii
Metody nauczania	M-2	Wykład problemowy z dyskusją
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: ocena podsumowująca poszczególne moduły treści przedmiotu
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Umiejętność powiązania w stopniu dostatecznym zjawisk ewolucyjnych ze zróżnicowaniem organizmów
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_U02	W wyniku przeprwadzonych zajęć student konstruuje drzewo filogenetyczne wybranego gatunku.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_U24	na podstawie znajomości procesów ewolucyjnych oraz rozwoju filo- i ontogenetycznego interpretuje i wyjaśnia podobieństwa oraz zróżnicowanie między organizmami
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_U02	rozumie literaturę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów w języku polskim; czyta ze zrozumieniem nieskomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
	P1A_U03	wykorzystuje dostępne źródła informacji, w tym źródła elektroniczne
	P1A_U07	wykazuje umiejętność poprawnego wnioskowania na podstawie danych pochodzących z różnych źródeł
	P1A_U10	posiada umiejętność wystąpień ustnych w języku polskim i języku obcym, dotyczących zagadnień szczegółowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_U01	potrafi pozyskiwać informacje z literatury, baz danych oraz innych właściwie dobranych źródeł, także w języku angielskim lub innym języku obcym uznawanym za język komunikacji międzynarodowej w zakresie studiowanego kierunku studiów; potrafi integrować uzyskane informacje, dokonywać ich interpretacji, a także wyciągać wnioski oraz formułować i uzasadniać opinie
Cel przedmiotu	C-3	Przedstawienie podstawowych pojęć z zakresu filogenetyki molekularnej. Zaprezentowanie drzew filogenetycznych i zegara molekularnego oraz możliwości ich wykorzystania w analizach.
Treści programowe	T-A-5	Metody i etapy konstrukcji drzew filogenetycznych.
	T-A-4	Czynniki wpływające na ewolucję sekwencji nukleotydowych i ewolucję białek.
	T-A-6	Przegląd programów komputerowych do analiz filogenetycznych.
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: ocena podsumowująca poszczególne moduły treści przedmiotu
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie umie skonstruować drzewa filogenetycznegomodelowych gatunków zwierząt.
	3,0	Student konstruuje drzewo filogentyczne modelowych gatunków zwierząt.
	3,5	Student biegle i poprawnie konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych gatunków zwierząt.
	4,0	Student biegle i poprawnie konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych i innych gatunków zwierząt.
	4,5	Student biegle i z wprawą konstruuje drzewo filogenetyczne modelowych i innych gatunków zwierząt.
	5,0	Student doskonalekonstruuje drzewo filogenetyczne wybranego dowolnego gatunku zwierząt.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_U03	W wyniku przeprowadzonych zajęć student analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_U24	na podstawie znajomości procesów ewolucyjnych oraz rozwoju filo- i ontogenetycznego interpretuje i wyjaśnia podobieństwa oraz zróżnicowanie między organizmami
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_U02	rozumie literaturę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów w języku polskim; czyta ze zrozumieniem nieskomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
	P1A_U03	wykorzystuje dostępne źródła informacji, w tym źródła elektroniczne
	P1A_U07	wykazuje umiejętność poprawnego wnioskowania na podstawie danych pochodzących z różnych źródeł
	P1A_U10	posiada umiejętność wystąpień ustnych w języku polskim i języku obcym, dotyczących zagadnień szczegółowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
	T1A_U01	potrafi pozyskiwać informacje z literatury, baz danych oraz innych właściwie dobranych źródeł, także w języku angielskim lub innym języku obcym uznawanym za język komunikacji międzynarodowej w zakresie studiowanego kierunku studiów; potrafi integrować uzyskane informacje, dokonywać ich interpretacji, a także wyciągać wnioski oraz formułować i uzasadniać opinie
Cel przedmiotu	C-5	Przedstawienie możliwości wykorzystywania filogenezy molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
Cel przedmiotu	C-4	Przedstawienie filogenezy molekularnej jako podstawy biologii porównawczej i ewolucyjnej.
Treści programowe	T-W-7	Filogeneza jako podstawa biologii porównawczej i ewolucyjnej oraz paleontologia molekularna.
Treści programowe	T-A-7	Zastosowanie analizy filogenetycznej i perspektywy wykorzystania w przyszłości.
Metody nauczania	M-2	Wykład problemowy z dyskusją
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie analizuje roli filogenetyki molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
	3,0	Student analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	3,5	Student biegle analizuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	4,0	Student biegle analizuje i charakteryzuje rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	4,5	Student biegle analizuje, charakteryzuje i tłumaczy rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.
	5,0	Student dosonale analizuje, charakteryzuje i tłumaczy rolę filogenetyki molekularnej w różnych dzidzinach nauki.

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_K01	Student posiądzie świadomość relacji pomiędzy organizmami istniejącymi obecnie i w przeszłości opierając się na bazie empirycznej
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_K02	wykazuje zrozumienie podstawowych zjawisk i procesów biologicznych, a przy ich interpretacji opiera się na podstawach empirycznych dostrzegając rolę metod matematycznych i statystycznych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_K01	rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie
	P1A_K04	prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
Cel przedmiotu	C-1	Zapoznanie studentów z historią myśli ewolucyjnej i innymi poglądami na powstanie i rozwój życia, z mechanizmami ewolucji na różnych poziomach organizmu: populacji, gatunku, oraz ze zjawiskami makroewolucyjnymi i megaewolucyjnymi.
Cel przedmiotu	C-2	Przybliżenie studentom paleontologii. Wykształcenie umiejętności swobodnego poruszania się po historii naszej planety, przedstawiając chronologiczny opis jej dziejów ze szczególnym uwzględnieniem zjawisk towarzyszących powstawaniu i wymieraniu gatunków. Studenci powinni zdobyć umiejętność rozpoznawania i powiązania obecnie żyjących organizmów z ich przodkami.
Treści programowe	T-A-3	Przegląd skamieniałości
	T-A-2	Dzieje życia na Ziemi
	T-A-1	Podstawy paleontologii
	T-W-1	Mechanizmy ewolucji na poziomie genetycznym
	T-W-3	Makroewolucja
	T-W-4	Megaewolucja
	T-W-2	Mechanizmy ewolucji na poziomie populacji i gatunku
Metody nauczania	M-2	Wykład problemowy z dyskusją
Metody nauczania	M-1	Wykład informacyjny z użyciem środków wizualnych
Sposób oceny	S-2	Ocena podsumowująca: ocena podsumowująca poszczególne moduły treści przedmiotu
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0
	3,0	Znajomość w stopniu dostatecznym ważnych ewolucyjnych zmian na przestrzeni dziejów Ziemi
	3,5
	4,0
	4,5
	5,0

Pole	KOD	Znaczenie kodu
Zamierzone efekty kształcenia	BI_1A_BIB-S-C7_K02	W wyniku przeprowadzonych zajęć student postrzega relacje między filogenetyką molekularną a innymi dziedzinami nauki
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiów	BI_1A_K03	rozumie potrzebę i zna możliwości ciągłego dokształcania się (studia drugiego i trzeciego stopnia, studia podyplomowe, kursy), pogłębiania własnej wiedzy w oparciu o naukowe źródła informacji oraz wykazuje chęć dzielenia się zdobytą wiedzą z innymi
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształcenia	P1A_K01	rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie
	P1A_K02	potrafi współdziałać i pracować w grupie, przyjmując w niej różne role
	P1A_K05	rozumie potrzebę podnoszenia kompetencji zawodowych i osobistych
	P1A_K07	wykazuje potrzebę stałego aktualizowania wiedzy kierunkowej
	P1A_K08	potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
	T1A_K01	rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie; potrafi inspirować i organizować proces uczenia się innych osób
	T1A_K06	potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
	T1A_K07	ma świadomość roli społecznej absolwenta uczelni technicznej, a zwłaszcza rozumie potrzebę formułowania i przekazywania społeczeństwu, w szczególności poprzez środki masowego przekazu, informacji i opinii dotyczących osiągnięć techniki i innych aspektów działalności inżynierskiej; podejmuje starania, aby przekazać takie informacje i opinie w sposób powszechnie zrozumiały
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżyniera	InzA_K02	potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
Cel przedmiotu	C-5	Przedstawienie możliwości wykorzystywania filogenezy molekularnej w różnych dziedzinach nauki.
Treści programowe	T-W-7	Filogeneza jako podstawa biologii porównawczej i ewolucyjnej oraz paleontologia molekularna.
Treści programowe	T-A-7	Zastosowanie analizy filogenetycznej i perspektywy wykorzystania w przyszłości.
Metody nauczania	M-2	Wykład problemowy z dyskusją
Sposób oceny	S-1	Ocena podsumowująca: Ocena podsumowująca znajomość zagadnień wykładowych
Kryteria oceny	Ocena	Kryterium oceny
	2,0	Student nie postrzega relacji między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	3,0	Student postrzega relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	3,5	Student postrzega i charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki.
	4,0	Student postrzega i charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany na pogłębianie wiedzy.
	4,5	Student postrzega i biegle charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany na pogłębianie wiedzy.
	5,0	Student postrzega i biegle charakteryzuje relacje między filogenetyką molekularą a innymi dziedzinami nauki oraz jest zorientowany i otwarty na pogłębianie wiedzy.