Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Nauk o Żywności i Rybactwa - Mikrobiologia (S2)

Sylabus przedmiotu Techniki obrazowania mikroskopowego z analizą danych:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Mikrobiologia
Forma studiów studia stacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta magister inżynier
Obszary studiów charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Techniki obrazowania mikroskopowego z analizą danych
Specjalność przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca Katedra Mikrobiologii Stosowanej i Fizjologii Żywienia Człowieka
Nauczyciel odpowiedzialny Elżbieta Bogusławska-Wąs <Elzbieta.Boguslawska-Was@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele Artur Bartkowiak <Artur-Bartkowiak@zut.edu.pl>, Krzysztof Formicki <Krzysztof.Formicki@zut.edu.pl>, Barbara Szymczak <Barbara.Szymczak@zut.edu.pl>
ECTS (planowane) 2,0 ECTS (formy) 2,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
laboratoriaL1 30 2,01,00zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Podstawowe wiadomości z optyki Podstawowe wiadomości z histologii

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Celem przedmiotu jest zapozanie słuchaczy z specjalistycznymi technikami mikroskopowymi stosowanymi w mikrobiologii stosowanej ze szczególnym uwzględnieniem diagnostyki mikrobiologicznej
C-2Student zdobędzie umiejętność obsługi róznego typu mikroskopów oraz wiedzę praktyczną dotyczącą preparatyki histologicznej

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Praktyczne zastosowanie binokularu do mierzenia kolonii bakteryjnych3
T-L-2Mikroskopia fluorescencyjna - Przygotowanie preparatów barwionych oranżem akrydyny. - Filtry fluorescencyjne i źródła światła wykorzystywane w obrazowaniu. - Składanie i analiza uzyskanych obrazów fluorescencji.7
T-L-3Mikroskopia konfokalna - zasady działania mikroskopu konfokalnego, - zastosowanie, - obrazowanie.8
T-L-4Mikroskopia elektronowa - wprowadzenie do zagadnienia mikroskopii elektronowej, - budowa i zasada działania, - podstawy fizyczne. - rodzaje mikroskopów elektronowych.5
T-L-5Mikroskopia sił atomowych: - historia mikroskopii AFM, - elementy składowe mikroskopu AFM, - metody obrazowania próbek, - możliwości wykorzystania mikroskopii AFM.5
T-L-6Zaliczenie zajęć2
30

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1uczestnictwo w zajęciach30
A-L-2Przygotowanie teoretyczne do zajęć9
A-L-3Przygotowanie prezentacji11
50

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1Prelekcja
M-2Pokaz specjalisycznych technik
M-3Wykład konwersatoryjny

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena formująca: ocena za przygotowanie do zajęć ocena za aktywność na zajęciach
S-2Ocena podsumowująca: pisemne zaliczenie ćwiczeń - kolokwium

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
MS_2A_B12_W01
Student zna i rozumie w stopniu pogłębionym techniki mikroskopowe służące obrazowaniu komórki z wykorzystaniem specjalistycznych mikroskopów.
MS_2A_W03, MS_2A_W05C-1T-L-3, T-L-2, T-L-4, T-L-5, T-L-1M-2, M-3, M-1S-2, S-1

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
MS_2A_B12_U01
Potrafi poprawnie ustawić i obsłużyć mikroskopy świetlne wg zasady Koehlera
MS_2A_U03C-1T-L-3, T-L-2, T-L-4, T-L-5, T-L-1M-2, M-3, M-1S-2, S-1

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
MS_2A_B12_K01
Student jest gotowy do samodzielnej pracy ze specjalistycznymi mikroskopami.
MS_2A_K03, MS_2A_K01C-1T-L-3, T-L-2, T-L-4, T-L-5, T-L-1M-2, M-3, M-1S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
MS_2A_B12_W01
Student zna i rozumie w stopniu pogłębionym techniki mikroskopowe służące obrazowaniu komórki z wykorzystaniem specjalistycznych mikroskopów.
2,0
3,0Student zna i rozumie techniki mikroskopowe służące obrazowaniu komórki z wykorzystaniem specjalistycznych mikroskopów w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
MS_2A_B12_U01
Potrafi poprawnie ustawić i obsłużyć mikroskopy świetlne wg zasady Koehlera
2,0
3,0Student potrafi poprawnie ustawić i obsłużyć mikroskopy świetlne wg zasady Koehlera w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
MS_2A_B12_K01
Student jest gotowy do samodzielnej pracy ze specjalistycznymi mikroskopami.
2,0
3,0Student jest gotowy do samodzoelnej pracy ze specjalistycznymi mikroskopami w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0

Literatura podstawowa

  1. Litwin J.A., Gajda M., Podstawy technik mikroskopowych, Wydawnictwo Uniwersytetu Jagielońskiego, Kraków, 2011
  2. Pluta M., Mikroskopia optyczna, PWN, Warszawa, 1982
  3. Kompendium histologii Podręcznik dla studentów nauk medycznych i przyrodniczychCichocki Tadeusz, Litwin Jan A., Mirecka Jadwiga, Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, Kraków, 2009, 4

Literatura dodatkowa

  1. Kurczyńska E.U., Borowska - Wykręt D., Mikroskopia świetlna w badaniach komórki roślinnej, PWN, Warszawa, 2007
  2. Journal of Microscopy

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Praktyczne zastosowanie binokularu do mierzenia kolonii bakteryjnych3
T-L-2Mikroskopia fluorescencyjna - Przygotowanie preparatów barwionych oranżem akrydyny. - Filtry fluorescencyjne i źródła światła wykorzystywane w obrazowaniu. - Składanie i analiza uzyskanych obrazów fluorescencji.7
T-L-3Mikroskopia konfokalna - zasady działania mikroskopu konfokalnego, - zastosowanie, - obrazowanie.8
T-L-4Mikroskopia elektronowa - wprowadzenie do zagadnienia mikroskopii elektronowej, - budowa i zasada działania, - podstawy fizyczne. - rodzaje mikroskopów elektronowych.5
T-L-5Mikroskopia sił atomowych: - historia mikroskopii AFM, - elementy składowe mikroskopu AFM, - metody obrazowania próbek, - możliwości wykorzystania mikroskopii AFM.5
T-L-6Zaliczenie zajęć2
30

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1uczestnictwo w zajęciach30
A-L-2Przygotowanie teoretyczne do zajęć9
A-L-3Przygotowanie prezentacji11
50
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięMS_2A_B12_W01Student zna i rozumie w stopniu pogłębionym techniki mikroskopowe służące obrazowaniu komórki z wykorzystaniem specjalistycznych mikroskopów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówMS_2A_W03Zna i rozumie w pogłębionym stopniu zagadnienia dotyczące mikroorganizmów, ich specyfiki, różnorodności i roli w naukach rolniczych i pokrewnych.
MS_2A_W05Zna i rozumie w pogłębionym stopniu zagadnienia dotyczące mikroorganizmów (wirusów, bakterii, grzybów) i pasożytów oraz metod diagnostycznych służących do ich wykrywania.
Cel przedmiotuC-1Celem przedmiotu jest zapozanie słuchaczy z specjalistycznymi technikami mikroskopowymi stosowanymi w mikrobiologii stosowanej ze szczególnym uwzględnieniem diagnostyki mikrobiologicznej
Treści programoweT-L-3Mikroskopia konfokalna - zasady działania mikroskopu konfokalnego, - zastosowanie, - obrazowanie.
T-L-2Mikroskopia fluorescencyjna - Przygotowanie preparatów barwionych oranżem akrydyny. - Filtry fluorescencyjne i źródła światła wykorzystywane w obrazowaniu. - Składanie i analiza uzyskanych obrazów fluorescencji.
T-L-4Mikroskopia elektronowa - wprowadzenie do zagadnienia mikroskopii elektronowej, - budowa i zasada działania, - podstawy fizyczne. - rodzaje mikroskopów elektronowych.
T-L-5Mikroskopia sił atomowych: - historia mikroskopii AFM, - elementy składowe mikroskopu AFM, - metody obrazowania próbek, - możliwości wykorzystania mikroskopii AFM.
T-L-1Praktyczne zastosowanie binokularu do mierzenia kolonii bakteryjnych
Metody nauczaniaM-2Pokaz specjalisycznych technik
M-3Wykład konwersatoryjny
M-1Prelekcja
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: pisemne zaliczenie ćwiczeń - kolokwium
S-1Ocena formująca: ocena za przygotowanie do zajęć ocena za aktywność na zajęciach
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student zna i rozumie techniki mikroskopowe służące obrazowaniu komórki z wykorzystaniem specjalistycznych mikroskopów w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięMS_2A_B12_U01Potrafi poprawnie ustawić i obsłużyć mikroskopy świetlne wg zasady Koehlera
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówMS_2A_U03Potrafi dobrać właściwe procedury i metody analityczne. Potrafi wykorzystać w praktyce podstawowe i specjalistyczne techniki i narzędzia badawcze właściwe dla mikrobiologii stosowanej i nauk pokrewnych.
Cel przedmiotuC-1Celem przedmiotu jest zapozanie słuchaczy z specjalistycznymi technikami mikroskopowymi stosowanymi w mikrobiologii stosowanej ze szczególnym uwzględnieniem diagnostyki mikrobiologicznej
Treści programoweT-L-3Mikroskopia konfokalna - zasady działania mikroskopu konfokalnego, - zastosowanie, - obrazowanie.
T-L-2Mikroskopia fluorescencyjna - Przygotowanie preparatów barwionych oranżem akrydyny. - Filtry fluorescencyjne i źródła światła wykorzystywane w obrazowaniu. - Składanie i analiza uzyskanych obrazów fluorescencji.
T-L-4Mikroskopia elektronowa - wprowadzenie do zagadnienia mikroskopii elektronowej, - budowa i zasada działania, - podstawy fizyczne. - rodzaje mikroskopów elektronowych.
T-L-5Mikroskopia sił atomowych: - historia mikroskopii AFM, - elementy składowe mikroskopu AFM, - metody obrazowania próbek, - możliwości wykorzystania mikroskopii AFM.
T-L-1Praktyczne zastosowanie binokularu do mierzenia kolonii bakteryjnych
Metody nauczaniaM-2Pokaz specjalisycznych technik
M-3Wykład konwersatoryjny
M-1Prelekcja
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: pisemne zaliczenie ćwiczeń - kolokwium
S-1Ocena formująca: ocena za przygotowanie do zajęć ocena za aktywność na zajęciach
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student potrafi poprawnie ustawić i obsłużyć mikroskopy świetlne wg zasady Koehlera w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięMS_2A_B12_K01Student jest gotowy do samodzielnej pracy ze specjalistycznymi mikroskopami.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówMS_2A_K03Jest gotowy do poniesienia odpowiedzialności za bezpieczeństwo pracy własnej i innych. Jest gotowy postępować w stanach zagrożenia.
MS_2A_K01Jest gotowy do ciągłego dokształcania się i konieczności podnoszenia kompetencji zawodowych. Wyznacza kierunki własnego rozwoju i kształcenia (trzeciego stopnia, studia podyplomowe, kursy).
Cel przedmiotuC-1Celem przedmiotu jest zapozanie słuchaczy z specjalistycznymi technikami mikroskopowymi stosowanymi w mikrobiologii stosowanej ze szczególnym uwzględnieniem diagnostyki mikrobiologicznej
Treści programoweT-L-3Mikroskopia konfokalna - zasady działania mikroskopu konfokalnego, - zastosowanie, - obrazowanie.
T-L-2Mikroskopia fluorescencyjna - Przygotowanie preparatów barwionych oranżem akrydyny. - Filtry fluorescencyjne i źródła światła wykorzystywane w obrazowaniu. - Składanie i analiza uzyskanych obrazów fluorescencji.
T-L-4Mikroskopia elektronowa - wprowadzenie do zagadnienia mikroskopii elektronowej, - budowa i zasada działania, - podstawy fizyczne. - rodzaje mikroskopów elektronowych.
T-L-5Mikroskopia sił atomowych: - historia mikroskopii AFM, - elementy składowe mikroskopu AFM, - metody obrazowania próbek, - możliwości wykorzystania mikroskopii AFM.
T-L-1Praktyczne zastosowanie binokularu do mierzenia kolonii bakteryjnych
Metody nauczaniaM-2Pokaz specjalisycznych technik
M-3Wykład konwersatoryjny
M-1Prelekcja
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: pisemne zaliczenie ćwiczeń - kolokwium
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student jest gotowy do samodzoelnej pracy ze specjalistycznymi mikroskopami w stopniu dostatecznym.
3,5
4,0
4,5
5,0