Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biotechnologia (S2)
specjalność: Bioinżynieria produkcji żywności

Sylabus przedmiotu Genetyka molekularna:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Biotechnologia
Forma studiów studia stacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta magister inżynier
Obszary studiów charakterystyki PRK, kompetencje inżynierskie PRK
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Genetyka molekularna
Specjalność Biotechnologia w produkcji roślinnej
Jednostka prowadząca Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin
Nauczyciel odpowiedzialny Piotr Masojć <Piotr.Masojc@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele Paweł Milczarski <Pawel.Milczarski@zut.edu.pl>
ECTS (planowane) 2,0 ECTS (formy) 2,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny 1 Grupa obieralna 1

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
wykładyW2 15 1,00,59zaliczenie
ćwiczenia audytoryjneA2 15 1,00,41zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Genetyka ogólna
W-2biologia molekularna

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1nabycie wiedzy na temat metod identyfikacji polimorficznych miejsc w sekwencji DNA, warunkujących zmienność ważnych cech użytkowych roślin oraz sposobu wykorzystania tej wiedzy w praktycznej hodowli

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
ćwiczenia audytoryjne
T-A-1Polimorfizm funkcjonalny dla cechy zapach ryżu1
T-A-2Polimorfizm funkcjonalny dla cechy długość ziarniaka ryżu1
T-A-3Polimorfizm funkcjonalny syntazy fitoenu u pszenicy warunkujący żółte zabarwienie ziarniaka1
T-A-4Polimorfizmy funkcjonalne warunkujące wzrost plonu i zawartości skrobi w ziarnie pszenicy1
T-A-5Polimorfizm funkcjonalny warunkujący smak marchwi1
T-A-6Polimorfizm funkcjonalny warunkujący odporność na patogeny1
T-A-7Przykład analizy QTL prowadzącej do ustalenia liczby loci warunkujących odporność na porastanie1
T-A-8Przykład analizy QTL określającej liczbę loci warunkujących aktywność alfa-amylazy1
T-A-9Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących odporność na porastanie1
T-A-10Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących aktywność alfa-amylazy1
T-A-11Przykład zastosowania markerów molekularnych do selekcji nowych odmian uprawnych3
T-A-12Zaliczenie ćwiczeń2
15
wykłady
T-W-1Metody detekcji polimorfizmów w sekwencjach DNA3
T-W-2Polimorfizm jednego nukleotydu i haplotypy1
T-W-3Markery allelospecyficzne1
T-W-4Metody rozróżniania kopii genów i rodzin wielogenowych1
T-W-5Opracowywanie markerów dla polimorfizmów funkcjonalnych1
T-W-6Identyfikacja sekwencji promotorowej i sekwencji regulatorowych1
T-W-7Wpływ mutacji intronowych na alternatywny splicing1
T-W-8Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez mapowanie QTL1
T-W-9Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez analizę skrajnych grup rekombinantów (BSG)1
T-W-10Identyfikacja genów złożonych cech poprzez mapowanie asocjacyjne1
T-W-11Strategia genów kandydatów w wykrywaniu markerów funkcjonalnych1
T-W-12Metody hodowli molekularnej1
T-W-13Molekularne metody ustalania podobieństwa genetycznego1
15

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
ćwiczenia audytoryjne
A-A-1uczestnictwo w ćwiczeniach15
A-A-2przygotowywanie referatów8
A-A-3przygotowanie do tematyki ćwiczeń7
30
wykłady
A-W-1Uczestnictwo w wykładach15
A-W-2Samodzielne opanowanie materiału z wykładów poprzez lekturę literatury8
A-W-3Przygotowanie do zaliczenia wykładów6
A-W-4Test zaliczeniowy2
31

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1wykład
M-2Prezentacja multimedialna
M-3Dyskusja panelowa

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena podsumowująca: Zaliczenie wykładów - test pisemny 10 pytań szczegółowych
S-2Ocena podsumowująca: ocena wystąpień referatowych studentów podczas ćwiczeń

Zamierzone efekty uczenia się - wiedza

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_W01
opisuje sposoby identyfikacji polimorfizmów funkcjonalnych DNA i metody opracowania markerów dla wspomagania hodowli roślin uprawnych
BTinz_2A_W07C-1T-W-1, T-W-10, T-W-3, T-W-2, T-W-6, T-W-5, T-W-7, T-W-8, T-W-9, T-W-11, T-W-12, T-W-13, T-W-4M-1, M-2S-1

Zamierzone efekty uczenia się - umiejętności

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_U01
student interpretuje wyniki badań naukowych (publikacje oryginalne angielskojęzyczne) w zakresie genetyki molekularnej roślin
BTinz_2A_U06, BTinz_2A_U05C-1T-W-1, T-W-10, T-W-3, T-W-2, T-W-6, T-W-5, T-W-7, T-W-8, T-W-9, T-W-11, T-W-12, T-W-4, T-A-7, T-A-8, T-A-9, T-A-10, T-A-11M-2, M-3S-2

Zamierzone efekty uczenia się - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty uczenia sięOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów uczenia się prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_K01
Ma świadomość konieczności ciągłego kontaktu z literaturą światowa poświęconą genetyce molekularnej roślin dla nadążenia nad nowymi metodami i strategiami badań
BTinz_2A_K01C-1T-A-7, T-A-8, T-A-9, T-A-10, T-A-11M-2, M-3S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_W01
opisuje sposoby identyfikacji polimorfizmów funkcjonalnych DNA i metody opracowania markerów dla wspomagania hodowli roślin uprawnych
2,0nie zna metod identyfikacji polimorfizmów DNA
3,0zna w stopniu podstawowym metody identyfikacji polimorfizmów w DNA
3,5zna w stopniu podstawowym metody identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli roślin
4,0zna biegle większość metod identyfikacji polimorfizmów DNA i sposobów ich wykorzystania w hodowli roslin
4,5zna dogłębnie wiekszość metod identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli
5,0zna dogłębnie wszystkie metody identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_U01
student interpretuje wyniki badań naukowych (publikacje oryginalne angielskojęzyczne) w zakresie genetyki molekularnej roślin
2,0nie umie zinterpretować wyników publikacji z zakresu genetyki molekularnej roślin
3,0interpretuje w stopniu podstawowym wyniki publikacji z genetyki molekularnej
3,5w zadowalającym stopniu interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
4,0szczegółowo interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
4,5w sposób dogłębny interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
5,0w sposób pełny interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej oraz dostrzega ograniczenia stosowanych technik

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt uczenia sięOcenaKryterium oceny
BT_2A_BTR-S-O1.3_K01
Ma świadomość konieczności ciągłego kontaktu z literaturą światowa poświęconą genetyce molekularnej roślin dla nadążenia nad nowymi metodami i strategiami badań
2,0brak świadomości konieczności kontaktu z literaturą światową
3,0świadomość konieczności kontaktu z literaturą przynajmniej krajową
3,5świadomość konieczności kontaktu z literaturą światową w postaci podręczników
4,0świadomość konieczności kontaktu z wybranymi publikacjami literatury światowej
4,5świadomośc konieczności kontaktu z najnowszą literaturą światową
5,0świadomość konieczności kontaktu z najnowszą i starszą literaturą światową

Literatura podstawowa

  1. S. Malepszy, Biotechnologia roślin, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2009

Literatura dodatkowa

  1. P. Węgleński, Genetyka molekularna, Państwowe Wydawnictwo naukowe PWN, Warszawa, 2006
  2. Autorzy angielskojęzyczni, Publikacje naukowe oryginalne prezentujące współczesne osiagnięcia aplikacyjne genetyki molekularnej roślin, światowe wydawnictwa czasopism naukowych, 2011

Treści programowe - ćwiczenia audytoryjne

KODTreść programowaGodziny
T-A-1Polimorfizm funkcjonalny dla cechy zapach ryżu1
T-A-2Polimorfizm funkcjonalny dla cechy długość ziarniaka ryżu1
T-A-3Polimorfizm funkcjonalny syntazy fitoenu u pszenicy warunkujący żółte zabarwienie ziarniaka1
T-A-4Polimorfizmy funkcjonalne warunkujące wzrost plonu i zawartości skrobi w ziarnie pszenicy1
T-A-5Polimorfizm funkcjonalny warunkujący smak marchwi1
T-A-6Polimorfizm funkcjonalny warunkujący odporność na patogeny1
T-A-7Przykład analizy QTL prowadzącej do ustalenia liczby loci warunkujących odporność na porastanie1
T-A-8Przykład analizy QTL określającej liczbę loci warunkujących aktywność alfa-amylazy1
T-A-9Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących odporność na porastanie1
T-A-10Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących aktywność alfa-amylazy1
T-A-11Przykład zastosowania markerów molekularnych do selekcji nowych odmian uprawnych3
T-A-12Zaliczenie ćwiczeń2
15

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Metody detekcji polimorfizmów w sekwencjach DNA3
T-W-2Polimorfizm jednego nukleotydu i haplotypy1
T-W-3Markery allelospecyficzne1
T-W-4Metody rozróżniania kopii genów i rodzin wielogenowych1
T-W-5Opracowywanie markerów dla polimorfizmów funkcjonalnych1
T-W-6Identyfikacja sekwencji promotorowej i sekwencji regulatorowych1
T-W-7Wpływ mutacji intronowych na alternatywny splicing1
T-W-8Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez mapowanie QTL1
T-W-9Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez analizę skrajnych grup rekombinantów (BSG)1
T-W-10Identyfikacja genów złożonych cech poprzez mapowanie asocjacyjne1
T-W-11Strategia genów kandydatów w wykrywaniu markerów funkcjonalnych1
T-W-12Metody hodowli molekularnej1
T-W-13Molekularne metody ustalania podobieństwa genetycznego1
15

Formy aktywności - ćwiczenia audytoryjne

KODForma aktywnościGodziny
A-A-1uczestnictwo w ćwiczeniach15
A-A-2przygotowywanie referatów8
A-A-3przygotowanie do tematyki ćwiczeń7
30
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1Uczestnictwo w wykładach15
A-W-2Samodzielne opanowanie materiału z wykładów poprzez lekturę literatury8
A-W-3Przygotowanie do zaliczenia wykładów6
A-W-4Test zaliczeniowy2
31
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBT_2A_BTR-S-O1.3_W01opisuje sposoby identyfikacji polimorfizmów funkcjonalnych DNA i metody opracowania markerów dla wspomagania hodowli roślin uprawnych
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_W07wykazuje pogłębioną wiedzę na temat budowy, funkcji oraz analizy komputerowej genów i genomów, metod dziedziczenia, jak również wpływu czynników genetycznych na kształtowanie środowiska
Cel przedmiotuC-1nabycie wiedzy na temat metod identyfikacji polimorficznych miejsc w sekwencji DNA, warunkujących zmienność ważnych cech użytkowych roślin oraz sposobu wykorzystania tej wiedzy w praktycznej hodowli
Treści programoweT-W-1Metody detekcji polimorfizmów w sekwencjach DNA
T-W-10Identyfikacja genów złożonych cech poprzez mapowanie asocjacyjne
T-W-3Markery allelospecyficzne
T-W-2Polimorfizm jednego nukleotydu i haplotypy
T-W-6Identyfikacja sekwencji promotorowej i sekwencji regulatorowych
T-W-5Opracowywanie markerów dla polimorfizmów funkcjonalnych
T-W-7Wpływ mutacji intronowych na alternatywny splicing
T-W-8Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez mapowanie QTL
T-W-9Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez analizę skrajnych grup rekombinantów (BSG)
T-W-11Strategia genów kandydatów w wykrywaniu markerów funkcjonalnych
T-W-12Metody hodowli molekularnej
T-W-13Molekularne metody ustalania podobieństwa genetycznego
T-W-4Metody rozróżniania kopii genów i rodzin wielogenowych
Metody nauczaniaM-1wykład
M-2Prezentacja multimedialna
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Zaliczenie wykładów - test pisemny 10 pytań szczegółowych
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0nie zna metod identyfikacji polimorfizmów DNA
3,0zna w stopniu podstawowym metody identyfikacji polimorfizmów w DNA
3,5zna w stopniu podstawowym metody identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli roślin
4,0zna biegle większość metod identyfikacji polimorfizmów DNA i sposobów ich wykorzystania w hodowli roslin
4,5zna dogłębnie wiekszość metod identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli
5,0zna dogłębnie wszystkie metody identyfikacji polimorfizmów DNA i sposoby ich wykorzystania w hodowli
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBT_2A_BTR-S-O1.3_U01student interpretuje wyniki badań naukowych (publikacje oryginalne angielskojęzyczne) w zakresie genetyki molekularnej roślin
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_U06dokonuje wszechstronnej analizy molekularnych podstaw ewolucji, a także czynników oddziałujących na funkcjonowanie genomu oraz transkryptomu; analizuje czynniki wpływające na zmienność organizmu
BTinz_2A_U05potrafi indywidualnie lub w grupie zaprojektować i zrealizować proces eksperymentalny, w tym przeprowadzić pomiary, znajdujące zastosowanie w biotechnologii; interpretuje uzyskane wyniki i wyciąga wnioski; prowadzi dyskusję w oparciu o samodzielnie zdobytą wiedzę posługując się językiem specjalistycznym
Cel przedmiotuC-1nabycie wiedzy na temat metod identyfikacji polimorficznych miejsc w sekwencji DNA, warunkujących zmienność ważnych cech użytkowych roślin oraz sposobu wykorzystania tej wiedzy w praktycznej hodowli
Treści programoweT-W-1Metody detekcji polimorfizmów w sekwencjach DNA
T-W-10Identyfikacja genów złożonych cech poprzez mapowanie asocjacyjne
T-W-3Markery allelospecyficzne
T-W-2Polimorfizm jednego nukleotydu i haplotypy
T-W-6Identyfikacja sekwencji promotorowej i sekwencji regulatorowych
T-W-5Opracowywanie markerów dla polimorfizmów funkcjonalnych
T-W-7Wpływ mutacji intronowych na alternatywny splicing
T-W-8Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez mapowanie QTL
T-W-9Identyfikacja genów warunkujących cechy złożone poprzez analizę skrajnych grup rekombinantów (BSG)
T-W-11Strategia genów kandydatów w wykrywaniu markerów funkcjonalnych
T-W-12Metody hodowli molekularnej
T-W-4Metody rozróżniania kopii genów i rodzin wielogenowych
T-A-7Przykład analizy QTL prowadzącej do ustalenia liczby loci warunkujących odporność na porastanie
T-A-8Przykład analizy QTL określającej liczbę loci warunkujących aktywność alfa-amylazy
T-A-9Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących odporność na porastanie
T-A-10Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących aktywność alfa-amylazy
T-A-11Przykład zastosowania markerów molekularnych do selekcji nowych odmian uprawnych
Metody nauczaniaM-2Prezentacja multimedialna
M-3Dyskusja panelowa
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: ocena wystąpień referatowych studentów podczas ćwiczeń
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0nie umie zinterpretować wyników publikacji z zakresu genetyki molekularnej roślin
3,0interpretuje w stopniu podstawowym wyniki publikacji z genetyki molekularnej
3,5w zadowalającym stopniu interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
4,0szczegółowo interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
4,5w sposób dogłębny interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej
5,0w sposób pełny interpretuje wyniki publikacji z genetyki molekularnej oraz dostrzega ograniczenia stosowanych technik
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty uczenia sięBT_2A_BTR-S-O1.3_K01Ma świadomość konieczności ciągłego kontaktu z literaturą światowa poświęconą genetyce molekularnej roślin dla nadążenia nad nowymi metodami i strategiami badań
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBTinz_2A_K01wykazuje potrzebę ciągłego podnoszenia wiedzy ogólnej i kierunkowej; ma świadomość celowości podnoszenia zdobytej wiedzy zarówno w działaniach zawodowych, jak i rozwoju osobistym
Cel przedmiotuC-1nabycie wiedzy na temat metod identyfikacji polimorficznych miejsc w sekwencji DNA, warunkujących zmienność ważnych cech użytkowych roślin oraz sposobu wykorzystania tej wiedzy w praktycznej hodowli
Treści programoweT-A-7Przykład analizy QTL prowadzącej do ustalenia liczby loci warunkujących odporność na porastanie
T-A-8Przykład analizy QTL określającej liczbę loci warunkujących aktywność alfa-amylazy
T-A-9Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących odporność na porastanie
T-A-10Przykład analizy BSG ustalającej liczbę i klasyfikację loci warunkujących aktywność alfa-amylazy
T-A-11Przykład zastosowania markerów molekularnych do selekcji nowych odmian uprawnych
Metody nauczaniaM-2Prezentacja multimedialna
M-3Dyskusja panelowa
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: ocena wystąpień referatowych studentów podczas ćwiczeń
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0brak świadomości konieczności kontaktu z literaturą światową
3,0świadomość konieczności kontaktu z literaturą przynajmniej krajową
3,5świadomość konieczności kontaktu z literaturą światową w postaci podręczników
4,0świadomość konieczności kontaktu z wybranymi publikacjami literatury światowej
4,5świadomośc konieczności kontaktu z najnowszą literaturą światową
5,0świadomość konieczności kontaktu z najnowszą i starszą literaturą światową