Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biologia (S2)
specjalność: Biologia molekularna i podstawy analityki

Sylabus przedmiotu Markery genetyczne:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Biologia
Forma studiów studia stacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta magister
Obszary studiów nauk przyrodniczych
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Markery genetyczne
Specjalność Biologia molekularna i podstawy analityki
Jednostka prowadząca Katedra Nauk o Zwierzętach Przeżuwających
Nauczyciel odpowiedzialny Andrzej Dybus <Andrzej.Dybus@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane) 2,0 ECTS (formy) 2,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
laboratoriaL3 30 1,50,41zaliczenie
wykładyW3 10 0,50,59zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Student powinien posiadać wiadomości z zakresu genetyki ogólnej oraz biologii molekularnej.

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
C-2Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
C-3Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
laboratoria
T-L-1Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.2
T-L-2Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.2
T-L-3Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.2
T-L-4Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.2
T-L-5Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.12
T-L-6Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.22
T-L-7Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.2
T-L-8Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.2
T-L-9Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.2
T-L-10Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.2
T-L-11Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.2
T-L-12Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.2
T-L-13Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.2
T-L-14Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).2
T-L-15Analiza wyników sekwencjonowania DNA.2
30
wykłady
T-W-1Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.2
T-W-2Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.2
T-W-3Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.2
T-W-4Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.2
T-W-5Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.2
10

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
laboratoria
A-L-1Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.30
A-L-2Samodzielne poszerzanie wiedzy teoretycznej.5
A-L-3Przygotowanie do zaliczenia materiału.10
45
wykłady
A-W-1Udział studenta w przeprowadzonych wykładach10
A-W-2Przygotowanie się do zaliczenia.5
15

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
M-2Metody problemowe (wykład problemowy, wykład konwersatoryjny).
M-3Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
S-2Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_W01
Definiuje typy markerów genetycznych.
BL_2A_W12P2A_W01, P2A_W05, P2A_W07C-1T-W-1M-1S-1
BL_2A_BLM-S-B7_W02
Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.
BL_2A_W12, BL_2A_W11P2A_W01, P2A_W04, P2A_W05, P2A_W07C-3T-W-2, T-W-5, T-W-3, T-W-4M-1, M-2S-1
BL_2A_BLM-S-B7_W03
Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.
BL_2A_W12, BL_2A_W03P2A_W01, P2A_W02, P2A_W05, P2A_W06, P2A_W07C-2T-L-1, T-L-2, T-L-4, T-L-3, T-L-5, T-L-6, T-L-7, T-L-8, T-L-9, T-L-10, T-L-11, T-L-12, T-L-13, T-L-14, T-L-15M-3S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_U04
Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.
BL_2A_U06P2A_U01, P2A_U03, P2A_U06C-2M-3S-2
BL_2A_BLM-S-B7_U05
Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.
BL_2A_U11, BL_2A_U06P2A_U01, P2A_U02, P2A_U03, P2A_U04, P2A_U06C-2, C-3M-3S-2
BL_2A_BLM-S-B7_U06
Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.
BL_2A_U09P2A_U01, P2A_U02, P2A_U04, P2A_U05C-3M-3S-2

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-B7_K01
Ma świadomość złożoności i różnorodności genomów.
BL_2A_K01P2A_K04, P2A_K07C-1T-W-2, T-W-5, T-W-1, T-W-3, T-W-4M-1S-1

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BL_2A_BLM-S-B7_W01
Definiuje typy markerów genetycznych.
2,0
3,0Student poprawnie definiuje wybrane typy markerów genetycznych
3,5
4,0
4,5
5,0
BL_2A_BLM-S-B7_W02
Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.
2,0
3,0Student poprawnie definiuje najważniejsze różnice w typie dziedziczenia niektórych chorób. Objaśnia niektóre mechanizmy genetycznej determinacji różnych cech.
3,5
4,0
4,5
5,0
BL_2A_BLM-S-B7_W03
Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre metody izolacji kwasów nukleinowych, dobiera odpowiedni typ markera genetycznego do zmiany w sekwencji.
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BL_2A_BLM-S-B7_U04
Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do preparatyki kwasów nukleinowych i ich oceny jakościowej/ ilościowej
3,5
4,0
4,5
5,0
BL_2A_BLM-S-B7_U05
Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do amplifikacji DNA in vitro oraz analizy zmienności w jego obrębie
3,5
4,0
4,5
5,0
BL_2A_BLM-S-B7_U06
Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.
2,0
3,0Student poprawnie interpretuje wyniki analizy SSCP, wykorzystuje odpowiednie oprogramowanie do odczytów wyników sekwencjonowania DNA
3,5
4,0
4,5
5,0

Literatura podstawowa

  1. Brown T.A., Genomy z CD-ROM, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2009
  2. Słomski R. (red.), Analiza DNA teoria i praktyka, Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Poznań, 2011
  3. Zwierzchowski L., Świtoński M., Genomika bydła i świń., Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Poznań, 2009

Literatura dodatkowa

  1. Bal J., Biologia molekularna w medycynie. Elementy genetyki klinicznej., Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2008

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.2
T-L-2Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.2
T-L-3Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.2
T-L-4Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.2
T-L-5Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.12
T-L-6Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.22
T-L-7Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.2
T-L-8Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.2
T-L-9Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.2
T-L-10Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.2
T-L-11Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.2
T-L-12Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.2
T-L-13Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.2
T-L-14Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).2
T-L-15Analiza wyników sekwencjonowania DNA.2
30

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.2
T-W-2Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.2
T-W-3Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.2
T-W-4Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.2
T-W-5Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.2
10

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1Uczestnictwo w zajęciach laboratoryjnych.30
A-L-2Samodzielne poszerzanie wiedzy teoretycznej.5
A-L-3Przygotowanie do zaliczenia materiału.10
45
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1Udział studenta w przeprowadzonych wykładach10
A-W-2Przygotowanie się do zaliczenia.5
15
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_W01Definiuje typy markerów genetycznych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_W12ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_W01rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
P2A_W05ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
P2A_W07ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotuC-1Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
Treści programoweT-W-1Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.
Metody nauczaniaM-1Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie definiuje wybrane typy markerów genetycznych
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_W02Rozróżnia choroby genetyczne dziedziczone autosomalnie recesywnie i dominująco. Objaśnia mechanizmy genetycznej determinacji otłuszczenia, miognezy, starzenia się organizmu oraz zaburzeń determinacji płci.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_W12ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
BL_2A_W11ma ogólną w niektórych obszarach pogłębioną wiedzę w zakresie funkcjonowania, morfologii i anatomii oraz aberracji wybranych narządów i układów organizmów żywych oraz procesów życiowych na różnych etapach rozwoju organizmu
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_W01rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
P2A_W04ma pogłębioną wiedzę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów umożliwiającą dostrzeganie związków i zależności w przyrodzie
P2A_W05ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
P2A_W07ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotuC-3Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Treści programoweT-W-2Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.
T-W-5Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.
T-W-3Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.
T-W-4Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.
Metody nauczaniaM-1Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
M-2Metody problemowe (wykład problemowy, wykład konwersatoryjny).
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie definiuje najważniejsze różnice w typie dziedziczenia niektórych chorób. Objaśnia niektóre mechanizmy genetycznej determinacji różnych cech.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_W03Rozróżnia metody izolacji kwasów nukleinowych. Dobiera metodę identyfikacji markera genetycznego w zależności od rodzaju sekwencji nukleotydowej, typu polimorfizmu sekwencji.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_W12ma zaawansowaną wiedzę na w zakresie funkcjonowania, ewolucji i analizy, w tym bioinformatycznej, genów i genomów, dziedziczenia genowego i pozagenowego oraz odpowiedzi genomu na czynniki występujące w środowisku
BL_2A_W03wykazuje się zaawansowaną znajomością metod, technik, technologii, narzędzi i materiałów pozwalających na badanie i wykorzystanie potencjału przyrody
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_W01rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
P2A_W02konsekwentnie stosuje i upowszechnia zasadę ścisłego, opartego na danych empirycznych, interpretowania zjawisk i procesów przyrodniczych w pracy badawczej i działaniach praktycznych
P2A_W05ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
P2A_W06ma wiedzę w zakresie statystyki na poziomie prognozowania (modelowania) przebiegu zjawisk i procesów przyrodniczych oraz ma znajomość specjalistycznych narzędzi informatycznych
P2A_W07ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotuC-2Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
Treści programoweT-L-1Zasady BHP w laboratorium. Obsługa urządzeń laboratoryjnych. Przygotowanie stanowisk do pracy.
T-L-2Izolacja kwasów nukleinowych z różnych tkanek. Porównanie metod izolacji DNA.
T-L-4Jakościowa oraz ilościowa ocena preparatów kwasów nukleinowych.
T-L-3Preparatyka RNA. Metody zabezpieczania RNA przed degradacją.
T-L-5Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR, PCR-RFLP, PCR-ACRS cz.1
T-L-6Techniki wykorzystywane w identyfikacji markerów genetycznych. PCR-indel, PCR-multipleks, LONG-PCR cz.2
T-L-7Wykrywanie nieznanych mutacji w sekwencjach DNA. PCR-SSCP.Elektroforeza poliakrylamidowa. Barwienie DNA srebrem.
T-L-8Diagnostyka chorób genetcznych. Polimorfizm indel genu PRNP owcy.
T-L-9Markery molekularne płci. Ustalanie płci ssaków i ptaków.
T-L-10Markery genetyczne otłuszczenia i umięśnienia. Polimorfizm genów leptyny i miostatyny.
T-L-11Analiza ekspresji genów cz.1 RT-PCR, półilościowa ocena poziomu ekspresji genów.
T-L-12Analiza ekspresji genów cz.2. real time-PCR, ilościowa ocena poziomu ekspresji genów.
T-L-13Markery genetyczne w identyfikacji gatunkowej. Międzygatunkowa analiza sekwencjii mtDNA wybranych gatunków.
T-L-14Markery genetyczne w identyfikacji osobniczej. Sekwencje powtórzone (STR, VNTR).
T-L-15Analiza wyników sekwencjonowania DNA.
Metody nauczaniaM-3Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre metody izolacji kwasów nukleinowych, dobiera odpowiedni typ markera genetycznego do zmiany w sekwencji.
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_U04Potrafi przeprowadzić preparatykę DNA/RNA z różnych tkanek. Interpretuje wyniki oceny ilościowej i jakościowej preparatów kwasów nukleinowych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U06potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U03wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
P2A_U06zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotuC-2Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
Metody nauczaniaM-3Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do preparatyki kwasów nukleinowych i ich oceny jakościowej/ ilościowej
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_U05Potrafi przygotować mieszaninę reakcyjną do przeprowadzenia syntezy DNA in vitro, wykorzystywać enzymy restrykcyjne do identyfikacji substytucji pojedynczych nukleotydów. Potrafi posługiwać się techniką PCR do identyfikacji polimorfizmu DNA typu ins/del, analizy ekspresji genów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U11wykorzystuje wiedzę z zakresu budowy i funkcji biologicznych białek, kwasów nukleinowych, węglowodanów, lipidów oraz hormonów i witamin; rozumie główne szlaki metaboliczne oraz mechanizmów regulacji metabolizmu, rozumie mechanizmy działania hormonów i ich rolę w organizmie;
BL_2A_U06potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U02biegle wykorzystuje literaturę naukową z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów, w języku polskim; czyta ze zrozumieniem skomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
P2A_U03wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
P2A_U04planuje i wykonuje zadania badawcze lub ekspertyzy pod kierunkiem opiekuna naukowego
P2A_U06zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotuC-2Przybliżenie aktualnych metod molekularnych stosowanych w celu identyfikacji i analizy markerów genetycznych.
C-3Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Metody nauczaniaM-3Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie wykorzystuje niektóre narzędzia do amplifikacji DNA in vitro oraz analizy zmienności w jego obrębie
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_U06Interpretuje wyniki analizy SSCP. Umie przeprowadzić barwienie żeli PAA srebrem. Potrafi odczytać wyniki sekwencjonowania DNA.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U09potrafi wykorzystać techniki molekularne stosowane w taksonomii roślin, zwierząt i ludzi, rozumie budowę i funkcje genomu organizmów eukariotycznych oraz procesy dziedziczenia, wykorzystuje metody biologii molekularnej;
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U02biegle wykorzystuje literaturę naukową z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów, w języku polskim; czyta ze zrozumieniem skomplikowane teksty naukowe w języku angielskim
P2A_U04planuje i wykonuje zadania badawcze lub ekspertyzy pod kierunkiem opiekuna naukowego
P2A_U05stosuje metody statystyczne oraz techniki i narzędzia informatyczne do opisu zjawisk i analizy danych o charakterze specjalistycznym
Cel przedmiotuC-3Wskazanie sposobów poszukiwania nowych markerów genetycznych.
Metody nauczaniaM-3Metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, metoda projektów).
Sposób ocenyS-2Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student poprawnie interpretuje wyniki analizy SSCP, wykorzystuje odpowiednie oprogramowanie do odczytów wyników sekwencjonowania DNA
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-B7_K01Ma świadomość złożoności i różnorodności genomów.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_K01wykazuje zrozumienie i przekonanie o poznawalności procesów i zjawisk biologicznych zachodzących w świecie żywych organizmów; w interpretowaniu procesów i zjawisk biologicznych wykorzystuje podejście naukowe
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_K04prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
P2A_K07systematycznie aktualizuje wiedzę przyrodniczą i zna jej praktyczne zastosowania
Cel przedmiotuC-1Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z markerami genetycznymi.
Treści programoweT-W-2Wykorzystanie martkerów molekularnych i cytogenetycznych w diagnostyce wad rozwojowych.
T-W-5Prosta definicja płci a złożony proces determinacji i różnicowania płciowego u ssków. Identyfikacja płci z wykorzystaniem markerów molekularnych.
T-W-1Definicje markerów genetycznych. Organizacja genomu ssaków. Charakterystyka markerów klasy I i II oraz możliwości ich wykorzystania w analizie wybranych cech u ssaków. Markery cytogenetyczne.
T-W-3Markery genetyczne w prognozowaniu otłuszczenia u ssaków na modelu mysim.
T-W-4Proces starzenia się - choroba genetyczna czy stan fizjologiczny? Progeria i przypadek Brooke Greenberg a merkery genetyczne starzenia się ssakówe.
Metody nauczaniaM-1Metody podające (wykład informacyjny, pogadanka, objaśnienie).
Sposób ocenyS-1Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.