Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Biologia (N2)
specjalność: Biologia roślin

Sylabus przedmiotu Techniki laboratoryjne w mikrobiologii:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Biologia
Forma studiów studia niestacjonarne Poziom drugiego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta magister
Obszary studiów nauk przyrodniczych
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Techniki laboratoryjne w mikrobiologii
Specjalność Biologia molekularna i podstawy analityki
Jednostka prowadząca Katedra Immunologii, Mikrobiologii i Chemii Fizjologicznej
Nauczyciel odpowiedzialny Paweł Nawrotek <Pawel.Nawrotek@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele Karol Fijałkowski <karol.fijalkowski@zut.edu.pl>
ECTS (planowane) 3,0 ECTS (formy) 3,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny Grupa obieralna

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
ćwiczenia audytoryjneA2 5 1,00,29zaliczenie
laboratoriaL2 5 1,00,29zaliczenie
wykładyW2 5 1,00,42zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Podstawowa wiedza z zakresu mikrobiologii, immunologii, wirusologii, genetyki.

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Głównym celem przedmiotu jest przekazanie studentom specjalistycznej wiedzy z zakresu klasycznych i nowoczesnych technik labaoratoryjnych stosowanych w mikrobiologii.
C-2Zapoznanie studentów z praktycznymi aspektami wykonywania badań z użyciem klasycznych testów fenotypowych, jak również nowoczesnych testów immunologicznych i molekularnych; weryfikowania uzyskiwanych wyników (walidacja testów); opracowywania (projektowania) nowych i optymalizowania istniejących procedur diagnostycznych, wykorzystujących wybrane techniki laboratoryjne, w celu szybszej oraz bardziej wiarygodnej identyfikacji i analizy zjadliwości czynników zakaźnych.

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
ćwiczenia audytoryjne
T-A-1Techniki laboratoryjne w chorobach zakaźnych. Postulaty GLP (ang. Good Laboratory Practice) w praktyce laboratoryjnej.1
T-A-2Pobieranie i transport prób materiałów do badań. Techniki fenotypowe w badaniach mikrobiologicznych.1
T-A-3Identyfikacja i analiza wybranych patogenów bakteryjnych – przykładowe procedury.1
T-A-4Przygotowanie i optymalizacja diagnostyki molekularnej, z użyciem technik in silico. Opracowywanie procedur diagnostycznych w oparciu o analizę in silico sekwencji nukleotydowych wybranych mikroorganizmów chorobotwórczych.1
T-A-5Filogenetyka molekularna i jej zastosowanie w badaniach mikrobiologicznych.1
5
laboratoria
T-L-1Metody izolacji drobnoustrojów z różnych środowisk naturalnych (woda, gleba, powietrze) i określanie ich liczebności. Izolowanie czystych kultur.1
T-L-2Analiza mikrobiologiczna wody do celów sanitarnych. Oznaczanie bakterii grupy coli – miano coli. Prowadzenie hodowli bakteryjnych na różnych podłożach.1
T-L-3Prowadzenie obserwacji mikroskopowych: przygotowywanie preparatów barwionych metodami prostymi i złożonymi, obserwacje przyżyciowe. Hodowla drobnoustrojów w warunkach tlenowych i beztlenowych.1
T-L-4Metody identyfikacji drobnoustrojów na podstawie cech biochemicznych.1
T-L-5Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki. Metody genetyczne w identyfikacji bakterii.1
5
wykłady
T-W-1Techniki molekularne w wykrywaniu patogenów bakteryjnych występujących w żywności – aspekty praktyczne.1
T-W-2Techniki immunologiczne w badaniach odporności przeciwzakaźnej. Ilościowe testy immunologiczne: immunofluorescencja (IFA), odczyny radioimmunologiczne (RIA), odczyny immunoenzymatyczne (EIA, ELISA).1
T-W-3Metody szybkiego immunofenotypowania krążących komórek (antygenów) – immunocytometria.1
T-W-4Przeciwciała monoklonalne i ich zastosowanie. Identyfikacja drobnoustrojów w oparciu o analizę genomu.1
T-W-5Techniki „blotting”. Wykrywanie czynników niekonwencjonalnych.1
5

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
ćwiczenia audytoryjne
A-A-1Uczestnictwo w zajęciach.5
A-A-2Studiowanie literatury przedmiotu.10
A-A-3Przygotowanie się do "wejściówek".9
A-A-4Przygotowanie się do zaliczenia ćwiczeń audytoryjnych.5
A-A-5Pisemne zaliczenie ćwiczeń audytoryjnych.1
30
laboratoria
A-L-1Uczestnictwo w zajęciach.5
A-L-2Przygotowanie się do "wejściówek".15
A-L-3Przygotowanie się do kolokwiów.10
30
wykłady
A-W-1Uczestnictwo w wykładach.5
A-W-2Studiowanie literatury przedmiotu.15
A-W-3Przygotowanie się do zaliczenia wykładów.9
A-W-4Pisemne zaliczenie wykładów.1
30

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1Wykład informacyjny z wykorzystaniem prezentacji multimedialnej.
M-2Opis technik laboratoryjnych stosowanych w mikrobiologii z wykorzystaniem specjalistycznych programów komputerowych i prezentacji multimedialnej.
M-3Ćwiczenia laboratoryjne (identyfikacja i analiza określonych drobnoustrojów z użyciem wybranych technik laboratoryjnych; praca indywidualna i w grupach).
M-4Dyskusja dydaktyczna i analiza sprawozdań.

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena formująca: "Wejściówki" na początku zajęć sprawdzające stopień przyswojenia przez studenta partii materiału opanowanej dzięki pracy własnej.
S-2Ocena formująca: "Wyjściówki" - ocena poprawności wykonania ćwiczeń laboratoryjnych na podstawie analizy wyników wykonywanych testów.
S-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
S-4Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
S-5Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-D2_W01
W zakresie wiedzy student nazywa, rozróżnia oraz charakteryzuje zarówno klasyczne, jak i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii.
BL_2A_W03, BL_2A_W05, BL_2A_W08P2A_W01, P2A_W02, P2A_W03, P2A_W04, P2A_W05, P2A_W06, P2A_W07C-1T-A-1, T-A-2, T-A-3, T-A-4, T-A-5, T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5M-1, M-2S-1, S-3, S-4, S-5

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-D2_U01
W zakresie umiejętności student odpowiednio dobiera i wykorzystuje zarówno klasyczne testy fenotypowe, jak również nowoczesne testy immunologiczne i molekularne.
BL_2A_U06P2A_U01, P2A_U03, P2A_U06C-2T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5M-2, M-3S-2, S-3, S-4
BL_2A_BLM-S-D2_U02
W zakresie umiejętności student weryfikuje uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
BL_2A_U06P2A_U01, P2A_U03, P2A_U06C-2T-L-1, T-L-2, T-L-3, T-L-4, T-L-5M-3, M-4S-2, S-3
BL_2A_BLM-S-D2_U03
W zakresie umiejętności student opracuje (zaprojektuje), z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico, nowe i/lub zoptymalizuje istniejące procedury badawcze.
BL_2A_U06, BL_2A_U07P2A_U01, P2A_U03, P2A_U05, P2A_U06C-2T-A-4, T-A-5M-2, M-4S-3, S-4

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BL_2A_BLM-S-D2_K01
W zakresie kompetencji student jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
BL_2A_K02, BL_2A_K03, BL_2A_K05P2A_K01, P2A_K02, P2A_K03, P2A_K04, P2A_K05, P2A_K07, P2A_K08C-1, C-2T-A-4, T-A-5M-1, M-2, M-4S-2, S-3, S-4

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BL_2A_BLM-S-D2_W01
W zakresie wiedzy student nazywa, rozróżnia oraz charakteryzuje zarówno klasyczne, jak i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii.
2,0Student nie potrafi w najprostszym zakresie objaśnić klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; nie potrafi zdefiniować podstawowych pojęć.
3,0Student posiada wiedzę z zakresu klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; w zakresie wyrażania wiedzy popełnia wiele błędów.
3,5Student objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii w stopniu zadowalającym; w zakresie opanowania wiedzy przyswoił zasadnicze treści programowe.
4,0Student szczegółowo objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii; w zakresie stosunku do wiedzy wykazuje duże zainteresowanie.
4,5Student wyczerpująco objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii; w zakresie stosunku do wiedzy wykazuje duże zainteresowanie.
5,0Student wykazuje dogłębną wiedzę na temat klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; w zakresie rozumienia wiedzy opanował wszystkie treści programowe.

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BL_2A_BLM-S-D2_U01
W zakresie umiejętności student odpowiednio dobiera i wykorzystuje zarówno klasyczne testy fenotypowe, jak również nowoczesne testy immunologiczne i molekularne.
2,0Student nie potrafi odpowiednio dobrać i wykorzystać klasycznych oraz nowoczesnych technik laboratoryjnych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
3,5Student potrafi na średnim poziomie odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
4,5Student potrafi dobrze dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
5,0Student potrafi bardzo dobrze dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
BL_2A_BLM-S-D2_U02
W zakresie umiejętności student weryfikuje uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
2,0Student nie potrafi weryfikować uzyskiwanych wyników badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
3,5Student potrafi na średnim poziomie weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
4,5Student potrafi dobrze weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
5,0Student potrafi bardzo dobrze weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
BL_2A_BLM-S-D2_U03
W zakresie umiejętności student opracuje (zaprojektuje), z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico, nowe i/lub zoptymalizuje istniejące procedury badawcze.
2,0Student nie potrafi opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowych i/lub zoptymalizować istniejących procedur badawczych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
3,5Student potrafi na średnim poziomie opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
4,5Student potrafi dobrze opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
5,0Student potrafi bardzo dobrze opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BL_2A_BLM-S-D2_K01
W zakresie kompetencji student jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
2,0Student nie jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz nie wykazuje kreatywności w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
3,0Student jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
3,5
4,0
4,5
5,0Student jest zdolny i w pełni kompetentny w zakresie wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.

Literatura podstawowa

  1. Grzybowski J., Reiss J., Praktyczna bakteriologia lekarska i sanitarna, Dom Wydawniczy Bellona, Warszawa, 2001
  2. Kayser F.H., Bienz K.A., Eckert J., Zinkernagel R.M., Mikrobiologia lekarska, Wydaw. Lekarskie PZWL, Warszawa, 2007
  3. Krawczyk B., Kur J., Diagnostyka molekularna w mikrobiologii, Wydaw. PG, Gdańsk, 2008
  4. Prastowska-Kątnik I. (red.), Immunochemia w biologii medycznej. Metody laboratoryjne, Wydaw. Naukowe PWN, Warszawa, 2009
  5. Tomaszewski J.J., Diagnostyka laboratoryjna, PZWL, Warszawa, 1993
  6. Zaremba M.L., Borowski J., Mikrobiologia lekarska, Wydaw. Lekarskie PZWL, Warszawa, 1997

Literatura dodatkowa

  1. Bednarski W., Reps A., Biotechnologia żywności, WNT, Lublin, 2003
  2. Boroń-Kaczmarska A., Furowicz A.J., Choroby odzwierzęce przenoszone drogą pokarmową, Wydaw. Lekarskie PZWL, Warszawa, 1999
  3. Czernomysy-Furowicz D., Karakulska J., Nawrotek P., Laboratoryjne eksperymenty w mikrobiologii, Wydaw. AR w Szczecinie, Szczecin, 2006
  4. Jędrychowski W., Epidemiologia w medycynie klinicznej i zdrowiu publicznym, Wydaw. UJ, Kraków, 2010
  5. Kowalski M.L., Immunologia kliniczna, Mediton Oficyna Wydawnicza, Łódź, 2000
  6. Singleton P., Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie, Wydaw. Naukowe PWN, Warszawa, 2000

Treści programowe - ćwiczenia audytoryjne

KODTreść programowaGodziny
T-A-1Techniki laboratoryjne w chorobach zakaźnych. Postulaty GLP (ang. Good Laboratory Practice) w praktyce laboratoryjnej.1
T-A-2Pobieranie i transport prób materiałów do badań. Techniki fenotypowe w badaniach mikrobiologicznych.1
T-A-3Identyfikacja i analiza wybranych patogenów bakteryjnych – przykładowe procedury.1
T-A-4Przygotowanie i optymalizacja diagnostyki molekularnej, z użyciem technik in silico. Opracowywanie procedur diagnostycznych w oparciu o analizę in silico sekwencji nukleotydowych wybranych mikroorganizmów chorobotwórczych.1
T-A-5Filogenetyka molekularna i jej zastosowanie w badaniach mikrobiologicznych.1
5

Treści programowe - laboratoria

KODTreść programowaGodziny
T-L-1Metody izolacji drobnoustrojów z różnych środowisk naturalnych (woda, gleba, powietrze) i określanie ich liczebności. Izolowanie czystych kultur.1
T-L-2Analiza mikrobiologiczna wody do celów sanitarnych. Oznaczanie bakterii grupy coli – miano coli. Prowadzenie hodowli bakteryjnych na różnych podłożach.1
T-L-3Prowadzenie obserwacji mikroskopowych: przygotowywanie preparatów barwionych metodami prostymi i złożonymi, obserwacje przyżyciowe. Hodowla drobnoustrojów w warunkach tlenowych i beztlenowych.1
T-L-4Metody identyfikacji drobnoustrojów na podstawie cech biochemicznych.1
T-L-5Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki. Metody genetyczne w identyfikacji bakterii.1
5

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Techniki molekularne w wykrywaniu patogenów bakteryjnych występujących w żywności – aspekty praktyczne.1
T-W-2Techniki immunologiczne w badaniach odporności przeciwzakaźnej. Ilościowe testy immunologiczne: immunofluorescencja (IFA), odczyny radioimmunologiczne (RIA), odczyny immunoenzymatyczne (EIA, ELISA).1
T-W-3Metody szybkiego immunofenotypowania krążących komórek (antygenów) – immunocytometria.1
T-W-4Przeciwciała monoklonalne i ich zastosowanie. Identyfikacja drobnoustrojów w oparciu o analizę genomu.1
T-W-5Techniki „blotting”. Wykrywanie czynników niekonwencjonalnych.1
5

Formy aktywności - ćwiczenia audytoryjne

KODForma aktywnościGodziny
A-A-1Uczestnictwo w zajęciach.5
A-A-2Studiowanie literatury przedmiotu.10
A-A-3Przygotowanie się do "wejściówek".9
A-A-4Przygotowanie się do zaliczenia ćwiczeń audytoryjnych.5
A-A-5Pisemne zaliczenie ćwiczeń audytoryjnych.1
30
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - laboratoria

KODForma aktywnościGodziny
A-L-1Uczestnictwo w zajęciach.5
A-L-2Przygotowanie się do "wejściówek".15
A-L-3Przygotowanie się do kolokwiów.10
30
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1Uczestnictwo w wykładach.5
A-W-2Studiowanie literatury przedmiotu.15
A-W-3Przygotowanie się do zaliczenia wykładów.9
A-W-4Pisemne zaliczenie wykładów.1
30
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-D2_W01W zakresie wiedzy student nazywa, rozróżnia oraz charakteryzuje zarówno klasyczne, jak i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_W03wykazuje się zaawansowaną znajomością metod, technik, technologii, narzędzi i materiałów pozwalających na badanie i wykorzystanie potencjału przyrody
BL_2A_W05posiada zaawansowaną wiedzę na temat możliwości wykorzystania metod obliczeniowych i informatycznych do modelowania zjawisk i procesów zachodzących na wszystkich poziomach hierarchicznej organizacji biologicznej
BL_2A_W08ma pogłębioną wiedzę na temat czynników zakaźnych organizmów żywych występujących w ekosystemie, jak również zna możliwości zabezpieczania się przed tymi czynnikami oraz wykorzystanie tych czynników przez człowieka
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_W01rozumie złożone zjawiska i procesy przyrodnicze
P2A_W02konsekwentnie stosuje i upowszechnia zasadę ścisłego, opartego na danych empirycznych, interpretowania zjawisk i procesów przyrodniczych w pracy badawczej i działaniach praktycznych
P2A_W03ma pogłębioną wiedzę z zakresu tych nauk ścisłych, z którymi związany jest studiowany kierunek studiów (w szczególności biofizyka, biochemia, biomatematyka, geochemia, biogeochemia, geofizyka)
P2A_W04ma pogłębioną wiedzę z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów umożliwiającą dostrzeganie związków i zależności w przyrodzie
P2A_W05ma wiedzę w zakresie aktualnie dyskutowanych w literaturze kierunkowej problemów z wybranej dziedziny nauki i dyscypliny naukowej
P2A_W06ma wiedzę w zakresie statystyki na poziomie prognozowania (modelowania) przebiegu zjawisk i procesów przyrodniczych oraz ma znajomość specjalistycznych narzędzi informatycznych
P2A_W07ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotuC-1Głównym celem przedmiotu jest przekazanie studentom specjalistycznej wiedzy z zakresu klasycznych i nowoczesnych technik labaoratoryjnych stosowanych w mikrobiologii.
Treści programoweT-A-1Techniki laboratoryjne w chorobach zakaźnych. Postulaty GLP (ang. Good Laboratory Practice) w praktyce laboratoryjnej.
T-A-2Pobieranie i transport prób materiałów do badań. Techniki fenotypowe w badaniach mikrobiologicznych.
T-A-3Identyfikacja i analiza wybranych patogenów bakteryjnych – przykładowe procedury.
T-A-4Przygotowanie i optymalizacja diagnostyki molekularnej, z użyciem technik in silico. Opracowywanie procedur diagnostycznych w oparciu o analizę in silico sekwencji nukleotydowych wybranych mikroorganizmów chorobotwórczych.
T-A-5Filogenetyka molekularna i jej zastosowanie w badaniach mikrobiologicznych.
T-W-1Techniki molekularne w wykrywaniu patogenów bakteryjnych występujących w żywności – aspekty praktyczne.
T-W-2Techniki immunologiczne w badaniach odporności przeciwzakaźnej. Ilościowe testy immunologiczne: immunofluorescencja (IFA), odczyny radioimmunologiczne (RIA), odczyny immunoenzymatyczne (EIA, ELISA).
T-W-3Metody szybkiego immunofenotypowania krążących komórek (antygenów) – immunocytometria.
T-W-4Przeciwciała monoklonalne i ich zastosowanie. Identyfikacja drobnoustrojów w oparciu o analizę genomu.
T-W-5Techniki „blotting”. Wykrywanie czynników niekonwencjonalnych.
Metody nauczaniaM-1Wykład informacyjny z wykorzystaniem prezentacji multimedialnej.
M-2Opis technik laboratoryjnych stosowanych w mikrobiologii z wykorzystaniem specjalistycznych programów komputerowych i prezentacji multimedialnej.
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: "Wejściówki" na początku zajęć sprawdzające stopień przyswojenia przez studenta partii materiału opanowanej dzięki pracy własnej.
S-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
S-4Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
S-5Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie wykładów.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0Student nie potrafi w najprostszym zakresie objaśnić klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; nie potrafi zdefiniować podstawowych pojęć.
3,0Student posiada wiedzę z zakresu klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; w zakresie wyrażania wiedzy popełnia wiele błędów.
3,5Student objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii w stopniu zadowalającym; w zakresie opanowania wiedzy przyswoił zasadnicze treści programowe.
4,0Student szczegółowo objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii; w zakresie stosunku do wiedzy wykazuje duże zainteresowanie.
4,5Student wyczerpująco objaśnia klasyczne i nowoczesne techniki laboratoryjne wykorzystywane w mikrobiologii; w zakresie stosunku do wiedzy wykazuje duże zainteresowanie.
5,0Student wykazuje dogłębną wiedzę na temat klasycznych i nowoczesnych technik laboratoryjnych wykorzystywanych w mikrobiologii; w zakresie rozumienia wiedzy opanował wszystkie treści programowe.
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-D2_U01W zakresie umiejętności student odpowiednio dobiera i wykorzystuje zarówno klasyczne testy fenotypowe, jak również nowoczesne testy immunologiczne i molekularne.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U06potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U03wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
P2A_U06zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie studentów z praktycznymi aspektami wykonywania badań z użyciem klasycznych testów fenotypowych, jak również nowoczesnych testów immunologicznych i molekularnych; weryfikowania uzyskiwanych wyników (walidacja testów); opracowywania (projektowania) nowych i optymalizowania istniejących procedur diagnostycznych, wykorzystujących wybrane techniki laboratoryjne, w celu szybszej oraz bardziej wiarygodnej identyfikacji i analizy zjadliwości czynników zakaźnych.
Treści programoweT-L-1Metody izolacji drobnoustrojów z różnych środowisk naturalnych (woda, gleba, powietrze) i określanie ich liczebności. Izolowanie czystych kultur.
T-L-2Analiza mikrobiologiczna wody do celów sanitarnych. Oznaczanie bakterii grupy coli – miano coli. Prowadzenie hodowli bakteryjnych na różnych podłożach.
T-L-3Prowadzenie obserwacji mikroskopowych: przygotowywanie preparatów barwionych metodami prostymi i złożonymi, obserwacje przyżyciowe. Hodowla drobnoustrojów w warunkach tlenowych i beztlenowych.
T-L-4Metody identyfikacji drobnoustrojów na podstawie cech biochemicznych.
T-L-5Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki. Metody genetyczne w identyfikacji bakterii.
Metody nauczaniaM-2Opis technik laboratoryjnych stosowanych w mikrobiologii z wykorzystaniem specjalistycznych programów komputerowych i prezentacji multimedialnej.
M-3Ćwiczenia laboratoryjne (identyfikacja i analiza określonych drobnoustrojów z użyciem wybranych technik laboratoryjnych; praca indywidualna i w grupach).
Sposób ocenyS-2Ocena formująca: "Wyjściówki" - ocena poprawności wykonania ćwiczeń laboratoryjnych na podstawie analizy wyników wykonywanych testów.
S-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
S-4Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0Student nie potrafi odpowiednio dobrać i wykorzystać klasycznych oraz nowoczesnych technik laboratoryjnych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
3,5Student potrafi na średnim poziomie odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie odpowiednio dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
4,5Student potrafi dobrze dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
5,0Student potrafi bardzo dobrze dobrać i wykorzystać klasyczne oraz nowoczesne techniki laboratoryjne.
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-D2_U02W zakresie umiejętności student weryfikuje uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U06potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U03wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
P2A_U06zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie studentów z praktycznymi aspektami wykonywania badań z użyciem klasycznych testów fenotypowych, jak również nowoczesnych testów immunologicznych i molekularnych; weryfikowania uzyskiwanych wyników (walidacja testów); opracowywania (projektowania) nowych i optymalizowania istniejących procedur diagnostycznych, wykorzystujących wybrane techniki laboratoryjne, w celu szybszej oraz bardziej wiarygodnej identyfikacji i analizy zjadliwości czynników zakaźnych.
Treści programoweT-L-1Metody izolacji drobnoustrojów z różnych środowisk naturalnych (woda, gleba, powietrze) i określanie ich liczebności. Izolowanie czystych kultur.
T-L-2Analiza mikrobiologiczna wody do celów sanitarnych. Oznaczanie bakterii grupy coli – miano coli. Prowadzenie hodowli bakteryjnych na różnych podłożach.
T-L-3Prowadzenie obserwacji mikroskopowych: przygotowywanie preparatów barwionych metodami prostymi i złożonymi, obserwacje przyżyciowe. Hodowla drobnoustrojów w warunkach tlenowych i beztlenowych.
T-L-4Metody identyfikacji drobnoustrojów na podstawie cech biochemicznych.
T-L-5Metody oznaczania wrażliwości bakterii na antybiotyki. Metody genetyczne w identyfikacji bakterii.
Metody nauczaniaM-3Ćwiczenia laboratoryjne (identyfikacja i analiza określonych drobnoustrojów z użyciem wybranych technik laboratoryjnych; praca indywidualna i w grupach).
M-4Dyskusja dydaktyczna i analiza sprawozdań.
Sposób ocenyS-2Ocena formująca: "Wyjściówki" - ocena poprawności wykonania ćwiczeń laboratoryjnych na podstawie analizy wyników wykonywanych testów.
S-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0Student nie potrafi weryfikować uzyskiwanych wyników badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
3,5Student potrafi na średnim poziomie weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
4,5Student potrafi dobrze weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
5,0Student potrafi bardzo dobrze weryfikować uzyskiwane wyniki badań realizowanych z użyciem wybranych technik laboratoryjnych.
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-D2_U03W zakresie umiejętności student opracuje (zaprojektuje), z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico, nowe i/lub zoptymalizuje istniejące procedury badawcze.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_U06potrafi przeprowadzać specjalistyczne prace eksperymentalne, potrafi stosować metody biologii i diagnostyki laboratoryjnej, potrafi wykonywać analizy laboratoryjne i posługiwać się sprzętem analitycznym i aparaturą badawczą, posiada umiejętność prowadzenia prac badawczych z użyciem materiału biologicznego, potrafi przeprowadzić badanie lub eksperyment z zastosowaniem zaawansowanych technik mikroskopowych
BL_2A_U07ma pogłębioną wiedzę bioinformatyczną i posiada umiejętność jej stosowania w pracy biologa, posługuje się metodami statystyki matematycznej w analizie danych doświadczalnych i obserwacji biologicznych;
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_U01stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P2A_U03wykazuje umiejętność krytycznej analizy i selekcji informacji, zwłaszcza ze źródeł elektronicznych
P2A_U05stosuje metody statystyczne oraz techniki i narzędzia informatyczne do opisu zjawisk i analizy danych o charakterze specjalistycznym
P2A_U06zbiera i interpretuje dane empiryczne oraz na tej podstawie formułuje odpowiednie wnioski
Cel przedmiotuC-2Zapoznanie studentów z praktycznymi aspektami wykonywania badań z użyciem klasycznych testów fenotypowych, jak również nowoczesnych testów immunologicznych i molekularnych; weryfikowania uzyskiwanych wyników (walidacja testów); opracowywania (projektowania) nowych i optymalizowania istniejących procedur diagnostycznych, wykorzystujących wybrane techniki laboratoryjne, w celu szybszej oraz bardziej wiarygodnej identyfikacji i analizy zjadliwości czynników zakaźnych.
Treści programoweT-A-4Przygotowanie i optymalizacja diagnostyki molekularnej, z użyciem technik in silico. Opracowywanie procedur diagnostycznych w oparciu o analizę in silico sekwencji nukleotydowych wybranych mikroorganizmów chorobotwórczych.
T-A-5Filogenetyka molekularna i jej zastosowanie w badaniach mikrobiologicznych.
Metody nauczaniaM-2Opis technik laboratoryjnych stosowanych w mikrobiologii z wykorzystaniem specjalistycznych programów komputerowych i prezentacji multimedialnej.
M-4Dyskusja dydaktyczna i analiza sprawozdań.
Sposób ocenyS-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
S-4Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0Student nie potrafi opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowych i/lub zoptymalizować istniejących procedur badawczych.
3,0Student potrafi w dostateczny sposób opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
3,5Student potrafi na średnim poziomie opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
4,0Student potrafi na dobrym poziomie opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
4,5Student potrafi dobrze opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
5,0Student potrafi bardzo dobrze opracować (zaprojektować) z użyciem odpowiednio dobranych technik in silico nowe i/lub zoptymalizować istniejące procedury badawcze.
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBL_2A_BLM-S-D2_K01W zakresie kompetencji student jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBL_2A_K02ma przekonanie o wartości i potrzebie odnoszenia zdobytej wiedzy ogólnej i kierunkowej w działaniach zawodowych, samorealizacji i rozwoju osobistym
BL_2A_K03rozumie potrzebę ukierunkowanego rozwijania własnej aktywności poznawczej i kompetencji zawodowych; wykazuje samodzielność poznawczą w oparciu o różne naukowe źródła informacji
BL_2A_K05wykazuje zdyscyplinowanie w pracy indywidualnej oraz aktywnie uczestniczy w pracy grupowej; samodzielnie i kreatywnie potrafi planować, organizować i realizować działania własne oraz zespołowe
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP2A_K01rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie, potrafi inspirować i organizować proces uczenia się innych osób
P2A_K02potrafi współdziałać i pracować w grupie, przyjmując w niej różne role
P2A_K03potrafi odpowiednio określić priorytety służące realizacji określonego przez siebie lub innych zadania
P2A_K04prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
P2A_K05rozumie potrzebę systematycznego zapoznawania się z czasopismami naukowymi i popularnonaukowymi, podstawowymi dla studiowanego kierunku studiów, w celu poszerzania i pogłębiania wiedzy
P2A_K07systematycznie aktualizuje wiedzę przyrodniczą i zna jej praktyczne zastosowania
P2A_K08potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
Cel przedmiotuC-1Głównym celem przedmiotu jest przekazanie studentom specjalistycznej wiedzy z zakresu klasycznych i nowoczesnych technik labaoratoryjnych stosowanych w mikrobiologii.
C-2Zapoznanie studentów z praktycznymi aspektami wykonywania badań z użyciem klasycznych testów fenotypowych, jak również nowoczesnych testów immunologicznych i molekularnych; weryfikowania uzyskiwanych wyników (walidacja testów); opracowywania (projektowania) nowych i optymalizowania istniejących procedur diagnostycznych, wykorzystujących wybrane techniki laboratoryjne, w celu szybszej oraz bardziej wiarygodnej identyfikacji i analizy zjadliwości czynników zakaźnych.
Treści programoweT-A-4Przygotowanie i optymalizacja diagnostyki molekularnej, z użyciem technik in silico. Opracowywanie procedur diagnostycznych w oparciu o analizę in silico sekwencji nukleotydowych wybranych mikroorganizmów chorobotwórczych.
T-A-5Filogenetyka molekularna i jej zastosowanie w badaniach mikrobiologicznych.
Metody nauczaniaM-1Wykład informacyjny z wykorzystaniem prezentacji multimedialnej.
M-2Opis technik laboratoryjnych stosowanych w mikrobiologii z wykorzystaniem specjalistycznych programów komputerowych i prezentacji multimedialnej.
M-4Dyskusja dydaktyczna i analiza sprawozdań.
Sposób ocenyS-2Ocena formująca: "Wyjściówki" - ocena poprawności wykonania ćwiczeń laboratoryjnych na podstawie analizy wyników wykonywanych testów.
S-3Ocena formująca: Ocena aktywności studenta na zajęciach.
S-4Ocena podsumowująca: Pisemne zaliczenie ćwiczeń.
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0Student nie jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz nie wykazuje kreatywności w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
3,0Student jest zdolny do wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.
3,5
4,0
4,5
5,0Student jest zdolny i w pełni kompetentny w zakresie wyboru odpowiedniej techniki laboratoryjnej w zależności od wyznaczonego celu oraz wykazuje kreatywność w tworzeniu nowych lub optymalizowaniu istniejących procedur badawczych.