Zachodniopomorski Uniwersytet Technologiczny w Szczecinie

Wydział Biotechnologii i Hodowli Zwierząt - Bioinformatyka (S1)
specjalność: Systemy informatyczne w biologii

Sylabus przedmiotu Kinetyka i modelowanie funkcjonalne enzymów:

Informacje podstawowe

Kierunek studiów Bioinformatyka
Forma studiów studia stacjonarne Poziom pierwszego stopnia
Tytuł zawodowy absolwenta inżynier
Obszary studiów nauk przyrodniczych, nauk technicznych, studiów inżynierskich
Profil ogólnoakademicki
Moduł
Przedmiot Kinetyka i modelowanie funkcjonalne enzymów
Specjalność przedmiot wspólny
Jednostka prowadząca Katedra Immunologii, Mikrobiologii i Chemii Fizjologicznej
Nauczyciel odpowiedzialny Radosław Drozd <Radoslaw.Drozd@zut.edu.pl>
Inni nauczyciele
ECTS (planowane) 3,0 ECTS (formy) 3,0
Forma zaliczenia zaliczenie Język polski
Blok obieralny 14 Grupa obieralna 2

Formy dydaktyczne

Forma dydaktycznaKODSemestrGodzinyECTSWagaZaliczenie
ćwiczenia audytoryjneA7 15 1,50,41zaliczenie
wykładyW7 15 1,50,59zaliczenie

Wymagania wstępne

KODWymaganie wstępne
W-1Znajomość podstaw chemii nieorganiczej i organicznej, biochemii, znajomośc języka angielskiego w stopniu średnio zaawansowanym

Cele przedmiotu

KODCel modułu/przedmiotu
C-1Przedmiot ma na celu wyuczenie umiejetności własciwego doboru i organizacji pracy z enzymami. Student zdobywa wiedzę niezbędną do oznaczania i identyfikacji enzymów. Poznaje podstawowe zagadnienia zwiazne z enzymologią jak również praktyczne aspekty pracy z enzymami w laboratorium badawczym i diagnostycznym

Treści programowe z podziałem na formy zajęć

KODTreść programowaGodziny
ćwiczenia audytoryjne
T-A-1Przygotowanie stanowiska pracy z enzymami4
T-A-2Metody utrzymawnia optymalnych warunków do oznaczania enzymów4
T-A-3Metody numeryczne do standaryzacji oznaczeń enzymatycznych3
T-A-4Podstawy enzymologii diagnostycznej2
T-A-5Walidacja wyników oznaczania enzymów2
15
wykłady
T-W-1Uwarunkowania strukturalne funkcji katalitycznych enzymów4
T-W-2Warunki środowiskowe wpływające na aktywność enzymów3
T-W-3Kinetyczne aspekty aktywności enzymów4
T-W-4Standaryzacja warunków oznaczania enzymów i miary aktywności enzymów2
T-W-5Metody identyfikacji, izolacji i oczyszczania enzymów2
15

Obciążenie pracą studenta - formy aktywności

KODForma aktywnościGodziny
ćwiczenia audytoryjne
A-A-1przygotowanie się do zajęć audytoryjnych15
A-A-2czytanie wskazanej literatury żrodłowej10
A-A-3napisanie raportu z zadania problemowego10
A-A-4przygotowanie prezentacji5
A-A-5przygotowanie sie do wejscówki5
45
wykłady
A-W-1uczestnictwo w zajęciach15
A-W-2przygotowanie do zajęc adytoryjnych17
A-W-3przygotowanie się do kolokwium12
44

Metody nauczania / narzędzia dydaktyczne

KODMetoda nauczania / narzędzie dydaktyczne
M-1wykład informacyjny
M-2wykład problemowy
M-3metoda przypdków, metoda sytuacyjna
M-4film
M-5metoda projektów

Sposoby oceny

KODSposób oceny
S-1Ocena formująca: Ocena stopnia opanowania materiału na podstawie wykonanej przez studenta prezentacji multimedialnej
S-2Ocena podsumowująca: Kolokwium sprawdzające i oceniające stopień przyswojenia i zrozumienia wykładanego materiału

Zamierzone efekty kształcenia - wiedza

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_W01
zna uwarunkowani strukturalne ksztłatujące parametry własciwe dla enzymów, posiada wiedzę dotyczaocą reakcji enzymatycznych, rozumie zaleności między otoxczeniem a aktywnością enzymów
BI_1A_W19P1A_W03, P1A_W05, P1A_W06, P1A_W07, P1A_W08, T1A_W02, T1A_W04, T1A_W05, T1A_W07, T1A_W08InzA_W02, InzA_W05C-1T-W-1, T-W-2, T-W-3, T-W-4, T-W-5M-3, M-5, M-1, M-2S-1, S-2

Zamierzone efekty kształcenia - umiejętności

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_U01
potrafi oznaczać parametry kinetyczne reakcji enzymatycznych, organizować własciwie swoje staniowisko pracy, wykorzystuje dpowiednie metody do modelowania środowiska działania enzymów
BI_1A_U19P1A_U06, P1A_U09, P1A_U11, T1A_U04, T1A_U05, T1A_U11InzA_U07C-1T-A-1, T-A-2, T-A-3, T-A-4, T-A-5M-5S-1, S-2

Zamierzone efekty kształcenia - inne kompetencje społeczne i personalne

Zamierzone efekty kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówOdniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaOdniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraCel przedmiotuTreści programoweMetody nauczaniaSposób oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_K01
posiada kompetencje pozwalające na samodzielną pracę z enzymami
BI_1A_K02, BI_1A_K04P1A_K01, P1A_K02, P1A_K03, P1A_K04, P1A_K06, P1A_K08, T1A_K02, T1A_K03, T1A_K04, T1A_K06InzA_K01, InzA_K02C-1T-A-1, T-A-2, T-A-3, T-A-4, T-A-5, T-W-4M-3, M-5S-1, S-2

Kryterium oceny - wiedza

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_W01
zna uwarunkowani strukturalne ksztłatujące parametry własciwe dla enzymów, posiada wiedzę dotyczaocą reakcji enzymatycznych, rozumie zaleności między otoxczeniem a aktywnością enzymów
2,0
3,0zna podstawy budowy molekularnej białek i rozumie ich wpływ na funkcjonowanie białek enzymatycznych
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - umiejętności

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_U01
potrafi oznaczać parametry kinetyczne reakcji enzymatycznych, organizować własciwie swoje staniowisko pracy, wykorzystuje dpowiednie metody do modelowania środowiska działania enzymów
2,0
3,0Zna podstawy budowej molekularnej białek oraz podstawowe metody komputerowe służace do ich analizy
3,5
4,0
4,5
5,0

Kryterium oceny - inne kompetencje społeczne i personalne

Efekt kształceniaOcenaKryterium oceny
BI_1A_BI-S-O11.3_K01
posiada kompetencje pozwalające na samodzielną pracę z enzymami
2,0
3,0Student ma kompetencje pozwalające na samodzielną pracę
3,5
4,0
4,5
5,0

Literatura podstawowa

  1. Lubert Stryer, Biochemia, PWN, Warszawa, 2010
  2. W. Minakowski S. Weidner, Biochemia kręgowców, PWN, Warszawa, 2011
  3. Jerzy Witwicki, Elementy enzymologii, PWN, Warszawa, 1984
  4. David Hawcroft, Diagnostic enzymology, ACOL, Londyn, 1986

Literatura dodatkowa

  1. Athel Cornish-Bowden, Fundamentals of Enzyme Kinetics, Portland Press, Londyn, 2002, III

Treści programowe - ćwiczenia audytoryjne

KODTreść programowaGodziny
T-A-1Przygotowanie stanowiska pracy z enzymami4
T-A-2Metody utrzymawnia optymalnych warunków do oznaczania enzymów4
T-A-3Metody numeryczne do standaryzacji oznaczeń enzymatycznych3
T-A-4Podstawy enzymologii diagnostycznej2
T-A-5Walidacja wyników oznaczania enzymów2
15

Treści programowe - wykłady

KODTreść programowaGodziny
T-W-1Uwarunkowania strukturalne funkcji katalitycznych enzymów4
T-W-2Warunki środowiskowe wpływające na aktywność enzymów3
T-W-3Kinetyczne aspekty aktywności enzymów4
T-W-4Standaryzacja warunków oznaczania enzymów i miary aktywności enzymów2
T-W-5Metody identyfikacji, izolacji i oczyszczania enzymów2
15

Formy aktywności - ćwiczenia audytoryjne

KODForma aktywnościGodziny
A-A-1przygotowanie się do zajęć audytoryjnych15
A-A-2czytanie wskazanej literatury żrodłowej10
A-A-3napisanie raportu z zadania problemowego10
A-A-4przygotowanie prezentacji5
A-A-5przygotowanie sie do wejscówki5
45
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta

Formy aktywności - wykłady

KODForma aktywnościGodziny
A-W-1uczestnictwo w zajęciach15
A-W-2przygotowanie do zajęc adytoryjnych17
A-W-3przygotowanie się do kolokwium12
44
(*) 1 punkt ECTS, odpowiada około 30 godzinom aktywności studenta
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBI_1A_BI-S-O11.3_W01zna uwarunkowani strukturalne ksztłatujące parametry własciwe dla enzymów, posiada wiedzę dotyczaocą reakcji enzymatycznych, rozumie zaleności między otoxczeniem a aktywnością enzymów
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBI_1A_W19wskazuje możliwości i znaczenie bezpiecznego stosowania procesów biologicznych i biotechnologicznych w różnych obszarach działalności człowieka i wykorzystanie w nich narzędzi informatycznych
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP1A_W03ma wiedzę z zakresu matematyki, fizyki i chemii niezbędną dla zrozumienia podstawowych procesów i zjawisk przyrodniczych
P1A_W05ma wiedzę w zakresie podstawowych kategorii pojęciowych i terminologii przyrodniczej oraz ma znajomość rozwoju dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów i stosowanych w nich metod badawczych
P1A_W06ma wiedzę w zakresie statystyki i informatyki na poziomie pozwalającym na opisywanie i interpretowanie zjawisk przyrodniczych
P1A_W07ma wiedzę w zakresie podstawowych technik i narzędzi badawczych stosowanych w zakresie dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P1A_W08rozumie związki między osiągnięciami wybranej dziedziny nauki i dyscypliny nauk przyrodniczych a możliwościami ich wykorzystania w życiu społeczno-gospodarczym z uwzględnieniem zrównoważonego użytkowania różnorodności biologicznej
T1A_W02ma podstawową wiedzę w zakresie kierunków studiów powiązanych ze studiowanym kierunkiem studiów
T1A_W04ma szczegółową wiedzę związaną z wybranymi zagadnieniami z zakresu studiowanego kierunku studiów
T1A_W05ma podstawową wiedzę o trendach rozwojowych z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
T1A_W07zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
T1A_W08ma podstawową wiedzę niezbędną do rozumienia społecznych, ekonomicznych, prawnych i innych pozatechnicznych uwarunkowań działalności inżynierskiej
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraInzA_W02zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane przy rozwiązywaniu prostych zadań inżynierskich z zakresu studiowanego kierunku studiów
InzA_W05zna typowe technologie inżynierskie w zakresie studiowanego kierunku studiów
Cel przedmiotuC-1Przedmiot ma na celu wyuczenie umiejetności własciwego doboru i organizacji pracy z enzymami. Student zdobywa wiedzę niezbędną do oznaczania i identyfikacji enzymów. Poznaje podstawowe zagadnienia zwiazne z enzymologią jak również praktyczne aspekty pracy z enzymami w laboratorium badawczym i diagnostycznym
Treści programoweT-W-1Uwarunkowania strukturalne funkcji katalitycznych enzymów
T-W-2Warunki środowiskowe wpływające na aktywność enzymów
T-W-3Kinetyczne aspekty aktywności enzymów
T-W-4Standaryzacja warunków oznaczania enzymów i miary aktywności enzymów
T-W-5Metody identyfikacji, izolacji i oczyszczania enzymów
Metody nauczaniaM-3metoda przypdków, metoda sytuacyjna
M-5metoda projektów
M-1wykład informacyjny
M-2wykład problemowy
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena stopnia opanowania materiału na podstawie wykonanej przez studenta prezentacji multimedialnej
S-2Ocena podsumowująca: Kolokwium sprawdzające i oceniające stopień przyswojenia i zrozumienia wykładanego materiału
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0zna podstawy budowy molekularnej białek i rozumie ich wpływ na funkcjonowanie białek enzymatycznych
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBI_1A_BI-S-O11.3_U01potrafi oznaczać parametry kinetyczne reakcji enzymatycznych, organizować własciwie swoje staniowisko pracy, wykorzystuje dpowiednie metody do modelowania środowiska działania enzymów
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBI_1A_U19wdraża wiedzę z zakresu biotechnologii i metodologii badań w środowisku odpowiadającym przyszłemu stanowisku pracy zawodowej
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP1A_U06przeprowadza obserwacje oraz wykonuje w terenie lub laboratorium proste pomiary fizyczne, biologiczne i chemiczne
P1A_U09umie przygotować w języku polskim i języku obcym dobrze udokumentowane opracowanie problemów z zakresu dziedzin nauki i dyscyplin naukowych, właściwych dla studiowanego kierunku studiów
P1A_U11uczy się samodzielnie w sposób ukierunkowany
T1A_U04potrafi przygotować i przedstawić w języku polskim i języku obcym prezentację ustną, dotyczącą szczegółowych zagadnień z zakresu studiowanego kierunku studiów
T1A_U05ma umiejętność samokształcenia się
T1A_U11ma przygotowanie niezbędne do pracy w środowisku przemysłowym oraz zna zasady bezpieczeństwa związane z tą pracą
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraInzA_U07potrafi ocenić przydatność rutynowych metod i narzędzi służących do rozwiązania prostego zadania inżynierskiego o charakterze praktycznym, charakterystycznego dla studiowanego kierunku studiów oraz wybrać i zastosować właściwą metodę i narzędzia
Cel przedmiotuC-1Przedmiot ma na celu wyuczenie umiejetności własciwego doboru i organizacji pracy z enzymami. Student zdobywa wiedzę niezbędną do oznaczania i identyfikacji enzymów. Poznaje podstawowe zagadnienia zwiazne z enzymologią jak również praktyczne aspekty pracy z enzymami w laboratorium badawczym i diagnostycznym
Treści programoweT-A-1Przygotowanie stanowiska pracy z enzymami
T-A-2Metody utrzymawnia optymalnych warunków do oznaczania enzymów
T-A-3Metody numeryczne do standaryzacji oznaczeń enzymatycznych
T-A-4Podstawy enzymologii diagnostycznej
T-A-5Walidacja wyników oznaczania enzymów
Metody nauczaniaM-5metoda projektów
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena stopnia opanowania materiału na podstawie wykonanej przez studenta prezentacji multimedialnej
S-2Ocena podsumowująca: Kolokwium sprawdzające i oceniające stopień przyswojenia i zrozumienia wykładanego materiału
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Zna podstawy budowej molekularnej białek oraz podstawowe metody komputerowe służace do ich analizy
3,5
4,0
4,5
5,0
PoleKODZnaczenie kodu
Zamierzone efekty kształceniaBI_1A_BI-S-O11.3_K01posiada kompetencje pozwalające na samodzielną pracę z enzymami
Odniesienie do efektów kształcenia dla kierunku studiówBI_1A_K02wykazuje zrozumienie podstawowych zjawisk i procesów biologicznych, a przy ich interpretacji opiera się na podstawach empirycznych dostrzegając rolę metod matematycznych i statystycznych
BI_1A_K04jest zdolny do efektywnej pracy samodzielnej i zespołowej, wykazuje odpowiedzialność za pracę własną, wspólnie realizowane zadania oraz powierzany sprzęt
Odniesienie do efektów zdefiniowanych dla obszaru kształceniaP1A_K01rozumie potrzebę uczenia się przez całe życie
P1A_K02potrafi współdziałać i pracować w grupie, przyjmując w niej różne role
P1A_K03potrafi odpowiednio określić priorytety służące realizacji określonego przez siebie lub innych zadania
P1A_K04prawidłowo identyfikuje i rozstrzyga dylematy związane z wykonywaniem zawodu
P1A_K06jest odpowiedzialny za bezpieczeństwo pracy własnej i innych; umie postępować w stanach zagrożenia
P1A_K08potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
T1A_K02ma świadomość ważności i zrozumienie pozatechnicznych aspektów i skutków działalności inżynierskiej, w tym jej wpływu na środowisko, i związanej z tym odpowiedzialności za podejmowane decyzje
T1A_K03potrafi współdziałać i pracować w grupie, przyjmując w niej różne role
T1A_K04potrafi odpowiednio określić priorytety służące realizacji określonego przez siebie lub innych zadania
T1A_K06potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
Odniesienie do efektów kształcenia prowadzących do uzyskania tytułu zawodowego inżynieraInzA_K01ma świadomość ważności i rozumie pozatechniczne aspekty i skutki działalności inżynierskiej, w tym jej wpływu na środowisko, i związanej z tym odpowiedzialności za podejmowane decyzje
InzA_K02potrafi myśleć i działać w sposób przedsiębiorczy
Cel przedmiotuC-1Przedmiot ma na celu wyuczenie umiejetności własciwego doboru i organizacji pracy z enzymami. Student zdobywa wiedzę niezbędną do oznaczania i identyfikacji enzymów. Poznaje podstawowe zagadnienia zwiazne z enzymologią jak również praktyczne aspekty pracy z enzymami w laboratorium badawczym i diagnostycznym
Treści programoweT-A-1Przygotowanie stanowiska pracy z enzymami
T-A-2Metody utrzymawnia optymalnych warunków do oznaczania enzymów
T-A-3Metody numeryczne do standaryzacji oznaczeń enzymatycznych
T-A-4Podstawy enzymologii diagnostycznej
T-A-5Walidacja wyników oznaczania enzymów
T-W-4Standaryzacja warunków oznaczania enzymów i miary aktywności enzymów
Metody nauczaniaM-3metoda przypdków, metoda sytuacyjna
M-5metoda projektów
Sposób ocenyS-1Ocena formująca: Ocena stopnia opanowania materiału na podstawie wykonanej przez studenta prezentacji multimedialnej
S-2Ocena podsumowująca: Kolokwium sprawdzające i oceniające stopień przyswojenia i zrozumienia wykładanego materiału
Kryteria ocenyOcenaKryterium oceny
2,0
3,0Student ma kompetencje pozwalające na samodzielną pracę
3,5
4,0
4,5
5,0